RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TRABD2AQ86V40 505 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ZNF611Q8N823 705 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CLHC1Q8NHS4 586 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 HSD17B8Q92506 261 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 JADE3Q92613 823 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ADGRG7Q96K78 797 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 NGBQ9NPG2 151 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 DUSP22Q9NRW4 184 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GIN1Q9NXP7 522 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 MID2Q9UJV3 735 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SNX8Q9Y5X2 465 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.29□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 MED12LQ86YW9 2145 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ZNF195O14628 629 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 FESP07332 822 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 YES1P07947 543 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 LINGO3P0C6S8 592 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 BCKDHAP12694 445 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ADH6P28332 368 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PCSK6P29122 969 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 SFTPDP35247 375 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 RPL3P39023 403 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CCT3P49368 545 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ATP5J2P56134 94 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 MLC1Q15049 377 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 KLHL26Q53HC5 615 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ZNF385BQ569K4 471 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CCNJQ5T5M9 372 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 KANK2Q63ZY3 851 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ZAR1Q86SH2 424 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TDRPQ86YL5 185 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 DDIASQ8IXT1 998 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 NATD1Q8N6N6 113 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 OR2T11Q8NH01 316 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 POC1BQ8TC44 478 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CDS1Q92903 461 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ARL8AQ96BM9 186 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 FCRL1Q96LA6 429 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PPP3R2Q96LZ3 170 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 KLHL15Q96M94 604 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 STACQ99469 402 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 NPAS1Q99742 590 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ACTRT3Q9BYD9 372 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 PIGUQ9H490 435 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 TUBB1Q9H4B7 451 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 C12orf49Q9H741 205 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ATAD3AQ9NVI7 634 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.28□□□□□ -1.24
COCH-211ENST00000557065 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.27□□□□□ -1.25
COCH-211ENST00000557065 HIVEP2P31629 2446 aa7.27□□□□□ -1.25
COCH-211ENST00000557065 TLDC2A0PJX2 215 aa7.27□□□□□ -1.25
COCH-211ENST00000557065 EFNA2O43921 213 aa7.27□□□□□ -1.25
COCH-211ENST00000557065 PEX11AO75192 247 aa7.27□□□□□ -1.25
COCH-211ENST00000557065 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
COCH-211ENST00000557065 PLAUP00749 431 aa7.27□□□□□ -1.25
COCH-211ENST00000557065 SHBGP04278 402 aa7.27□□□□□ -1.25
COCH-211ENST00000557065 CD3EP07766 207 aa7.27□□□□□ -1.25
COCH-211ENST00000557065 KRT16P08779 473 aa7.27□□□□□ -1.25
COCH-211ENST00000557065 IL32P24001 234 aa7.27□□□□□ -1.25
COCH-211ENST00000557065 ELK4P28324 431 aa7.27□□□□□ -1.25
COCH-211ENST00000557065 AGTR1P30556 359 aa7.27□□□□□ -1.25
COCH-211ENST00000557065 HPCAL1P37235 193 aa7.27□□□□□ -1.25
COCH-211ENST00000557065 P2RX1P51575 399 aa7.27□□□□□ -1.25
COCH-211ENST00000557065 ATP12AP54707 1039 aa7.27□□□□□ -1.25
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