RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556237.1

HIF1A-208, Transcript of hypoxia inducible factor 1 subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene HIF1A, Length 595 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1A-208ENST00000556237 SOCS2O14508 198 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 PLD2O14939 933 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 ACOX3O15254 700 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 E2F6O75461 281 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 REM1O75628 298 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 PRSS23O95084 383 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 TNFSF15O95150 251 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 LGI1O95970 557 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 CLPSP04118 112 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 SEMG1P04279 462 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 IFNW1P05000 195 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 CD63P08962 238 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 NPIPA8P0DM63 369 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 CT45A8P0DMV1 189 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 CT45A9P0DMV2 189 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 IL7RP16871 459 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 TCN2P20062 427 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 DRD5P21918 477 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 PRKACGP22612 351 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 MAGEA2P43356 314 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 ARHGDIAP52565 204 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 IST1P53990 364 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 SLC37A1P57057 533 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 KCNAB2Q13303 367 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 TAF11Q15544 211 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 NRF1Q16656 503 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 CT45A2Q5DJT8 189 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 C3orf38Q5JPI3 329 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 BICRALQ6AI39 1079 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 TBPL2Q6SJ96 375 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 TMEM205Q6UW68 189 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 IZUMO2Q6UXV1 221 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 NPSR1Q6W5P4 371 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 FRRS1Q6ZNA5 592 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 ASCL5Q7RTU5 278 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 CARM1Q86X55 608 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 KBTBD2Q8IY47 623 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 ZNF619Q8N2I2 560 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 CLIP4Q8N3C7 705 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 CBR4Q8N4T8 237 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 OR1N1Q8NGS0 311 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 PMM1Q92871 262 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 SDCCAG3Q96C92 435 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 VSTM2LQ96N03 204 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 LPAR4Q99677 370 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 DDA1Q9BW61 102 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 PINK1Q9BXM7 581 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 ITPAQ9BY32 194 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 SLC26A1Q9H2B4 701 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 CDIP1Q9H305 208 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 REEP1Q9H902 201 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 POLE3Q9NRF9 147 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 KLHL28Q9NXS3 571 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 COPS7AQ9UBW8 275 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 CBLCQ9ULV8 474 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 OAZ3Q9UMX2 235 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 ABCG2Q9UNQ0 655 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 SATB2Q9UPW6 733 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 C15orf41Q9Y2V0 281 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 ENPP4Q9Y6X5 453 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 U3KQV3 271 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 GPR179Q6PRD1 2367 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 ZNF318Q5VUA4 2279 aa5.85□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 PCNX2A6NKB5 2137 aa5.84□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 AGAP5A6NIR3 686 aa5.84□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 OR6C76A6NM76 312 aa5.84□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 PROB1E7EW31 1015 aa5.84□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 J3KTA2 159 aa5.84□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 M0R3H8 397 aa5.84□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 RASAL1O95294 804 aa5.84□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 IGKV1D-16P01601 117 aa5.84□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 IGKV3-11P04433 115 aa5.84□□□□□ -1.47
HIF1A-208ENST00000556237 DBIP07108 87 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
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