RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 AMDHD1Q96NU7 426 aa7.56□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.56□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 OR10A4Q9H209 315 aa7.56□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 C12orf49Q9H741 205 aa7.56□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.56□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 DCDC2Q9UHG0 476 aa7.56□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 KCNS2Q9ULS6 477 aa7.56□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.56□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 GXYLT2A0PJZ3 443 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 GJE1A6NN92 205 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 B4DXG7 233 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 ALG1L2C9J202 215 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 H3BNH8 94 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 SCDO00767 359 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 TNFSF11O14788 317 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 ADAMDEC1O15204 470 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 PDPK1O15530 556 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 HSPA4LO95757 839 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 NUDT14O95848 222 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 PLAUP00749 431 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 IFI6P09912 130 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 ALOX5P09917 674 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 DANCRP0C864 163 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 MYL2P10916 166 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 IGFBP5P24593 272 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 LCN1P31025 176 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 EIF1P41567 113 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 SLC6A8P48029 635 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 SERPINB4P48594 390 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 GZMKP49863 264 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 DEFA6Q01524 100 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 SLC18A2Q05940 514 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 GUSBP1Q15486 140 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 FAM166AQ6J272 317 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 NOXRED1Q6NXP6 359 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 GALNT10Q86SR1 603 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 GGNQ86UU5 652 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 C3orf56Q8N813 242 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 GATSQ8NAP1 163 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 NUP43Q8NFH3 380 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 HSD17B8Q92506 261 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 PIK3R3Q92569 461 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 FBXW5Q969U6 566 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 ARL8AQ96BM9 186 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 L3HYPDHQ96EM0 354 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 RNF145Q96MT1 663 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 KCNA7Q96RP8 456 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 PARD6BQ9BYG5 372 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 ALG2Q9H553 416 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 UBQLN4Q9NRR5 601 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 RAB21Q9UL25 225 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 LIPT1Q9Y234 373 aa7.55□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 A0A0A6YYJ9 748 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 A0A0J9YW62 118 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 A0A1W2PP18 115 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 A0A1W2PRB8 838 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 C7orf72A4D263 438 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 SLCO1B7G3V0H7 640 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 GOLGA8RI6L899 631 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 SLC28A1O00337 649 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 RGS14O43566 566 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 PRKD3O94806 890 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 NKX2-2O95096 273 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 PSMG1O95456 288 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 NGFRP08138 427 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 PYGBP11216 843 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 ATP6V1C1P21283 382 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 AGTR1P30556 359 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 SFTPDP35247 375 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 PRIM2P49643 509 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 TMEM44Q2T9K0 475 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 FAM219BQ5XKK7 198 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 WDR93Q6P2C0 686 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.54□□□□□ -1.2
TROAP-208ENST00000548817 APOOLQ6UXV4 268 aa7.54□□□□□ -1.2
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