RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	BEND3	Q5T5X7	828 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CENPU	Q71F23	418 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF329	Q86UD4	541 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LUZP1	Q86V48	1076 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PSKH2	Q96QS6	385 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR174	Q9BXC1	333 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NT5DC2	Q9H857	520 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	GHRL	Q9UBU3	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CACNG5	Q9UF02	275 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	EMCN	Q9ULC0	261 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308		Q9Y3F1	56 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CACNA1B	Q00975	2339 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM186A	A6NE01	2351 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	C5orf42	Q9H799	3197 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0J9YVX5	310 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ESYT2	A0FGR8	921 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PPIAL4D	F5H284	164 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308		K7ERI5	159 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	EI24	O14681	340 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CTAGE5	O15320	804 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	OR1F1	O43749	312 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CIAO1	O76071	339 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF432	O94892	652 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	IGSF6	O95976	241 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PGK1	P00558	417 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MT-ND1	P03886	318 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CPN1	P15169	458 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	HNF1A	P20823	631 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	UQCRC2	P22695	453 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ANOS1	P23352	680 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	UCP1	P25874	307 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SAA4	P35542	130 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM187	Q14656	261 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	EMC2	Q15006	297 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	WLS	Q5T9L3	541 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TRPV1	Q8NER1	839 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NUP37	Q8NFH4	326 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LHX4	Q969G2	390 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NABP1	Q96AH0	204 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NTNG2	Q96CW9	530 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LITAF	Q99732	161 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LIME1	Q9H400	295 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	FGF22	Q9HCT0	170 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RAI14	Q9P0K7	980 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SI	P14410	1827 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0G2JMZ2	1700 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LRIT2	A6NDA9	550 aa		3.37	□□□□□ -1.87

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