RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 COX18Q8N8Q8 333 aa10.56□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 OR2V1Q8NHB1 315 aa10.56□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa10.56□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 OSTF1Q92882 214 aa10.56□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 CAVIN3Q969G5 261 aa10.56□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 SMR3AQ99954 134 aa10.56□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC39A3Q9BRY0 314 aa10.56□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ACTRT3Q9BYD9 372 aa10.56□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNE5Q9UJ90 142 aa10.56□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 PROCRQ9UNN8 238 aa10.56□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 SCDO00767 359 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 TNFSF11O14788 317 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAJA2O60884 412 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 HSPA4LO95757 839 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 DHRS4L1P0CG22 281 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 PRPS1L1P21108 318 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 HPCAL1P37235 193 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 CLDN8P56748 225 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 PPP2R2AP63151 447 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 EMX2Q04743 252 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 NDUFAF6Q330K2 333 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 EMBQ6PCB8 327 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 SZRD1Q7Z422 152 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 LILRA2Q8N149 483 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 CLEC4FQ8N1N0 589 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 MREGQ8N565 214 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 NATD1Q8N6N6 113 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 OR6K3Q8NGY3 331 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 GPR119Q8TDV5 335 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ROBO4Q8WZ75 1007 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 PIK3IP1Q96FE7 263 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 OR7D2Q96RA2 312 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 SDF2Q99470 211 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 PIP5K1AQ99755 562 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 SRXN1Q9BYN0 137 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM185BQ9H7F4 350 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 HHATLQ9HCP6 504 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 NEUROD4Q9HD90 331 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ASIC5Q9NY37 505 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 CARD8Q9Y2G2 431 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 SNX8Q9Y5X2 465 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ACTL7BQ9Y614 415 aa10.55□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF195O14628 629 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ANKRD28O15084 1053 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 DSCAMO60469 2012 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 FCMRO60667 390 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 C1QCP02747 245 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ADH6P28332 368 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 MAPK1P28482 360 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 RPL3P39023 403 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP12AP54707 1039 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 FOXF1Q12946 379 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ACKR1Q16570 336 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC25A53Q5H9E4 307 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 DCST2Q5T1A1 773 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 HBMQ6B0K9 141 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 OLIG3Q7RTU3 272 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 CLECL1Q8IZS7 167 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF781Q8N8C0 355 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 FNDC5Q8NAU1 212 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 OR56A1Q8NGH5 318 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 OR5D16Q8NGK9 328 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 FBXO27Q8NI29 283 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 SFXN5Q8TD22 340 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ADAMTS15Q8TE58 950 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 JADE3Q92613 823 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 TUBGCP3Q96CW5 907 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ARSGQ96EG1 525 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 PKNOX2Q96KN3 472 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 KLHL15Q96M94 604 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 SORT1Q99523 831 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 MED18Q9BUE0 208 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 DUSP26Q9BV47 211 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 KLHL4Q9C0H6 718 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 HOXD1Q9GZZ0 328 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF226Q9NYT6 803 aa10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa10.53□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 SOX30O94993 753 aa10.53□□□□□ -0.72
CLSTN3-211ENST00000541667 PLAUP00749 431 aa10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms