RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	PFN4	Q8NHR9	129 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SDF2	Q99470	211 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SLC22A5	O76082	557 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ADRB1	P08588	477 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PSKH1	P11801	424 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ATF1	P18846	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	NOS3	P29474	1203 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	RAB28	P51157	221 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PPP2CB	P62714	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PPP2CA	P67775	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	IL10RA	Q13651	578 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CRMP1	Q14194	572 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	BIVM	Q86UB2	503 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	TTL	Q8NG68	377 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	RFK	Q969G6	155 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	RAB7B	Q96AH8	199 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	TEAD3	Q99594	435 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ASF1A	Q9Y294	204 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897		A0A0B4J2E0	115 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897		A0A1B0GX12	115 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	C5orf58	C9J3I9	102 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	GPR171	O14626	319 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CHST10	O43529	356 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	BNIP3L	O60238	219 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	OR2A4	O95047	310 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	EML2	O95834	649 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	ATP1B1	P05026	303 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	EPX	P11678	715 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	NDUFV2	P19404	249 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CERS1	P27544	350 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	GPR1	P46091	355 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	GPR4	P46093	362 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	PITPNB	P48739	271 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	TAF12	Q16514	161 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	RPE65	Q16518	533 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	DUSP5	Q16690	384 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CDH24	Q86UP0	819 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.09	□□□□□ -1.76

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