RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 RFC3P40938 356 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 CPA2P48052 419 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 ACTR3P61158 418 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 FLYWCH1Q4VC44 716 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 GPAT3Q53EU6 434 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 GCNT6Q5T4J0 391 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 TIGD3Q6B0B8 471 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF619Q8N2I2 560 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 FBXO27Q8NI29 283 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM19Q96HH6 336 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 TTTY12Q9BZ98 90 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 BCL2L10Q9HD36 194 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 ZFP64Q9NPA5 681 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 ASF1BQ9NVP2 202 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 CMTM6Q9NX76 183 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 KLRF1Q9NZS2 232 aa11.61□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 TTLL8A6PVC2 850 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 SCO2O43819 266 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 FKBP6O75344 327 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 CLPTM1O96005 669 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 BCHEP06276 602 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 PGM1P36871 562 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 NUDT2P50583 147 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 MLLT10P55197 1068 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 PDK3Q15120 406 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 GPR68Q15743 365 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 CD226Q15762 336 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 AAGABQ6PD74 315 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 ARPINQ7Z6K5 226 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 SERPINA11Q86U17 422 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 ZZZ3Q8IYH5 903 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM251Q8N6I4 163 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 METTL25Q8N6Q8 603 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 OR10A6Q8NH74 314 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 FAR1Q8WVX9 515 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF583Q96ND8 569 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 SH3GL1Q99961 368 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 UBQLN3Q9H347 655 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 PLGRKTQ9HBL7 147 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 DTNAQ9Y4J8 743 aa11.6□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 NDUFB5O43674 189 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC28A2O43868 658 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 PGM3O95394 542 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 ANGPTL1O95841 491 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 CRYABP02511 175 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 TDGF1P3P51864 188 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 ARPC4P59998 168 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 FADS6Q8N9I5 356 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 OIT3Q8WWZ8 545 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 PMM1Q92871 262 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF597Q96LX8 424 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 GNRHR2Q96P88 292 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 NCKAP5O14513 1909 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A0G2JPF8 293 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 AGAP5A6NIR3 686 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 GNB5O14775 395 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 OIP5O43482 229 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 CIB2O75838 187 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 PCSK6P29122 969 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 ADH7P40394 386 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 CRISP3P54108 245 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 PPIAP62937 165 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 CDK6Q00534 326 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 PLAURQ03405 335 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 RBBP4Q09028 425 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 ART3Q13508 389 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 PDZK1Q5T2W1 519 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM180AQ6UWF9 173 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 PLCZ1Q86YW0 608 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 NFKBIDQ8NI38 313 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 DUSP19Q8WTR2 217 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 NR4A3Q92570 626 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 UBAP1Q9NZ09 502 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 CALML5Q9NZT1 146 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 ABCD2Q9UBJ2 740 aa11.59□□□□□ -0.55
RPUSD4-208ENST00000533628 USP22Q9UPT9 525 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms