RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 YPEL5P62699 121 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 SHC2P98077 582 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 NPRL3Q12980 569 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 KIR2DS3Q14952 304 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 GRK1Q15835 563 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 KLHL26Q53HC5 615 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 FAM92BQ6ZTR7 304 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 NRROSQ86YC3 692 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 RAB43Q86YS6 212 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 SYNPOQ8N3V7 929 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 CSNK1A1LQ8N752 337 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 DENND6BQ8NEG7 585 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 GPR151Q8TDV0 419 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 WDR34Q96EX3 536 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 SSX3Q99909 188 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 CNPPD1Q9BV87 410 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 NIT2Q9NQR4 276 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 GAB2Q9UQC2 676 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 CACNA1EQ15878 2313 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PPV9 198 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PR48 441 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 M0R129 80 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 GPR37O15354 613 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 RGS10O43665 173 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 FHP07954 510 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 FBP1P09467 338 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 ARAFP10398 606 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 AHRP35869 848 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 HLCSP50747 726 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 SLC16A1P53985 500 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 MAZP56270 477 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 SKP1P63208 163 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 HYAL2Q12891 473 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF311Q5JNZ3 666 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 PDZK1Q5T2W1 519 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 DNASE1L2Q92874 299 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2FQ969M7 185 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 NXPE2Q96DL1 559 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 C16orf58Q96GQ5 468 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 NEU1Q99519 415 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 SLAMF7Q9NQ25 335 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 PHF11Q9UIL8 331 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-208ENST00000519076 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 FAM227AF5H4B4 570 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 SIGLEC6O43699 453 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 KLHL18O94889 574 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 EPHA2P29317 976 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 RYKP34925 604 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 DAPP51397 102 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 ITGA1P56199 1179 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA1024LP59773 190 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 CLN3Q13286 438 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 MPEG1Q2M385 716 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 BTBD16Q32M84 506 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 MLIPQ5VWP3 458 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA0895LQ68EN5 471 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF793Q6ZN11 406 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 COX18Q8N8Q8 333 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 DTD1Q8TEA8 209 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 SLC7A6Q92536 515 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 HSPA12BQ96MM6 686 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 AMDHD1Q96NU7 426 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 PINK1Q9BXM7 581 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 TEX12Q9BXU0 123 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 MMP27Q9H306 513 aa7.34□□□□□ -1.24
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