RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 UMPSP11172 480 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 NCK1P16333 377 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ST3GAL3Q11203 375 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 C1orf61Q13536 156 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 CRMP1Q14194 572 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 MICAQ29983 383 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 SGK2Q9HBY8 427 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 RASD1Q9Y272 281 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 USP16Q9Y5T5 823 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 USP6P35125 1406 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A0U1RQS6 177 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 CTAGE15A4D2H0 777 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 H3BMQ9 156 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF264O43296 627 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ACADSP16219 412 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 MAGEA8P43361 318 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ALDH3B2P48448 385 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 CUL2Q13617 745 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 NDUFA9Q16795 377 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 TP53I3Q53FA7 332 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 TEX44Q53QW1 395 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 CTAGE6Q86UF2 777 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM80Q96HE8 168 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 OR5B2Q96R09 309 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC77Q9BR77 488 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 TIGARQ9NQ88 270 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 SHISA9B4DS77 424 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 SGK1O00141 431 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 NBR2O15453 112 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 HPP00738 406 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 POU2F1P14859 743 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.438e-7■■■■■ 32.7
PGGT1B-205ENST00000514178 LIM2P55344 173 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 SEC61GP60059 68 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 CCNA1P78396 465 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC10A1Q14973 349 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 KLHL22Q53GT1 634 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBP1Q9H171 429 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ARMCX1Q9P291 453 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 SNTNA6NMZ2 147 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 FCN1O00602 326 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 HSMCR30P0CW71 290 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 CT45A10P0DMU9 189 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 LTB4RQ15722 352 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 PANK3Q9H999 370 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 KANK1Q14678 1352 aa6.1□□□□□ -1.43
PGGT1B-205ENST00000514178 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
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