RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 METTL11BQ5VVY1 283 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf62Q7Z3J2 963 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 MOB3BQ86TA1 216 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf40Q8IXQ3 194 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA3Q8NHX4 192 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 APMAPQ9HDC9 416 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF221Q9UK13 617 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 ARPC3O15145 178 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SNNO75324 88 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SCGNO76038 276 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 NOL4O94818 638 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 GAS8-AS1O95177 125 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 LRATO95237 230 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SERTAD2Q14140 314 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 LAGE3Q14657 143 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 LPAL2Q16609 132 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SLC5A12Q1EHB4 618 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 GGTA1PQ4G0N0 100 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM52BQ4KMG9 183 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 EIPR1Q53HC9 387 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 RNLSQ5VYX0 342 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 PMF1Q6P1K2 205 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 DHRSXQ8N5I4 330 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 OR2T33Q8NG76 320 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 AMDHD1Q96NU7 426 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 TGM7Q96PF1 710 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 HCFC1P51610 2035 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SRRM5B3KS81 715 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 B4DXG7 233 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 UGT2B17O75795 530 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV1-2P23083 117 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 EFNA3P52797 238 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A1P53007 311 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 CD47Q08722 323 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 C15orf32Q32M92 178 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 C10orf120Q5SQS8 335 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC26Q8TAB7 109 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 CITED1Q99966 193 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 PCSK1NQ9UHG2 260 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 RSPH14Q9UHP6 348 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 METTL21EPA6NDL7 271 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 CABYRO75952 493 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 DBTP11182 482 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 BCL3P20749 454 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 CALB2P22676 271 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 ST3GAL3Q11203 375 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 TGIF1Q15583 401 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 QRICH1Q2TAL8 776 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 KCNIP4Q6PIL6 250 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 CADM2Q8N3J6 435 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SHC3Q92529 594 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 CCT8L2Q96SF2 557 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 DPH7Q9BTV6 452 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 POGZQ7Z3K3 1410 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 H3BMQ9 156 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 HSMCR30P0CW71 290 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 ERVPABLB-1P60509 514 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2HP62256 183 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 ASAH1Q13510 395 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 Q1RN00 199 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A10Q63ZE4 541 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 MARCH9Q86YJ5 346 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 NAXDQ8IW45 347 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 MTURNQ8N3F0 131 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 OR4D5Q8NGN0 318 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 SLC41A3Q96GZ6 507 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 PSKH2Q96QS6 385 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB18Q99592 522 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 TSSK1BQ9BXA7 367 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 NANSQ9NR45 359 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 UFSP2Q9NUQ7 469 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa5.88□□□□□ -1.47
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