RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF681Q96N22 645 aa5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 DACH2Q96NX9 599 aa5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 FRG2BQ96QU4 278 aa5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 NODALQ96S42 347 aa5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 SERPINI1Q99574 410 aa5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 FUT8Q9BYC5 575 aa5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR41Q9HAD4 459 aa5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF225Q9UK10 706 aa5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 EML6Q6ZMW3 1958 aa5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 NINQ8N4C6 2090 aa5.76□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 TLN2Q9Y4G6 2542 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 MED12Q93074 2177 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A096LPK6 155 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 A8MXE2 369 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 B4DXG7 233 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP6CO00743 305 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 STX16O14662 325 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 ACOX3O15254 700 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 UGT2B11O75310 529 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 CBR3O75828 277 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 RAF1P04049 648 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 SBK3P0C264 359 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 CTAGE8P0CG41 777 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 GFAPP14136 432 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 DRD5P21918 477 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 PPICP45877 212 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 LHX2P50458 406 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 DGKQP52824 942 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 DCAF7P61962 342 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 RPP38P78345 283 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 PHEXP78562 749 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 FOXF2Q12947 444 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 TRAF3Q13114 568 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 GGTA1PQ4G0N0 100 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC48A1Q6P1K1 146 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 Q6ZNX1 250 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 CTAGE4Q8IX94 777 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 PRR22Q8IZ63 422 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 WFDC11Q8NEX6 87 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 OR1J4Q8NGS1 313 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC44A1Q8WWI5 657 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC9A6Q92581 669 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 ZFP3Q96NJ6 502 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIB1Q96RU8 372 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 TUBA1CQ9BQE3 449 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC1Q9BTT6 524 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 SFXN3Q9BWM7 321 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 OR2B2Q9GZK3 357 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 GRPEL1Q9HAV7 217 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 MAT2BQ9NZL9 334 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 PCTPQ9UKL6 214 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 PYCARDQ9ULZ3 195 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 CAMK2AQ9UQM7 478 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 CFL2Q9Y281 166 aa5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 COL6A5A8TX70 2615 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 ATRQ13535 2644 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 FBN3Q75N90 2809 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 C1orf226A1L170 272 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 OR6C70A6NIJ9 312 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 CLCA1A8K7I4 914 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 HCRTR2O43614 444 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 ZIC3O60481 467 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 TSPAN2O60636 221 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 TNFSF13O75888 250 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 RPS17P08708 135 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 RBP1P09455 135 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 CT45A8P0DMV1 189 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 CT45A9P0DMV2 189 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 CYP4B1P13584 511 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 NT5EP21589 574 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 CHMP24386 653 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 TYK2P29597 1187 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 FEN1P39748 380 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 GAS1P54826 345 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 HMGCS1Q01581 520 aa5.74□□□□□ -1.49
PRPF40A-210ENST00000489741 C2orf54Q08AI8 447 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms