RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 SERINC4A6NH21 518 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 SHISA8B8ZZ34 492 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 HMGN4O00479 90 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF264O43296 627 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 CYP7B1O75881 506 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 GUSBP08236 651 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 ZCCHC18P0CG32 403 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 UBL4AP11441 157 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF17P17021 662 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 BMP5P22003 454 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 CTSSP25774 331 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF117Q03924 483 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF141Q15928 474 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 OLIG3Q7RTU3 272 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 ZFP90Q8TF47 636 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC46Q96FV0 321 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 UCN2Q96RP3 112 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 SIKE1Q9BRV8 207 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 RABEP2Q9H5N1 569 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 NPHS2Q9NP85 383 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 DCTN4Q9UJW0 460 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 TNFRSF21O75509 655 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 UGT2B17O75795 530 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 NR2F1P10589 423 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 OPRM1P35372 400 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF1P41567 113 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 CRATP43155 626 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 MAGEA8P43361 318 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP4BP51164 291 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 CCR4P51679 360 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 SQLEQ14534 574 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 SGCBQ16585 318 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM44Q2T9K0 475 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 PLPPR5Q32ZL2 321 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 AGKQ53H12 422 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 CBLN3Q6UW01 205 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF619Q8N2I2 560 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 C9orf106Q8NAJ2 232 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 NAXEQ8NCW5 288 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 OIT3Q8WWZ8 545 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 ZFP3Q96NJ6 502 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 TPT1P8Q9HAU6 139 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM33Q9UPN9 1127 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 HEATR5AQ86XA9 2040 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 MED12LQ86YW9 2145 aa17.39■□□□□ 0.38
SH3BP4-209ENST00000484097 NR5A2O00482 541 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 RCBTB2O95199 551 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 H6PDO95479 791 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 CSTAP01040 98 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 C1QCP02747 245 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ME2P23368 584 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF136P52737 540 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 CBFBQ13951 182 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 SYPL1Q16563 259 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 NDUFAF6Q330K2 333 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 COX20Q5RI15 118 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PDSS1Q5T2R2 415 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC2A7Q6PXP3 512 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 STON2Q8WXE9 905 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 GTF2H4Q92759 462 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 SPDL1Q96EA4 605 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF145Q96MT1 663 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 SPOCK3Q9BQ16 436 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PINK1Q9BXM7 581 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 LAT2Q9GZY6 243 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 SAP130Q9H0E3 1048 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ENKD1Q9H0I2 346 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 MED4Q9NPJ6 270 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM45AQ9NWC5 275 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 CLCF1Q9UBD9 225 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ICAM5Q9UMF0 924 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A0G2JND7 137 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 C7orf72A4D263 438 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM247A6NEH6 219 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 OIP5O43482 229 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 KIAA0513O60268 411 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 CLDN20P56880 219 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 RAC1P63000 192 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 CHRNEQ04844 493 aa17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms