RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 UCN2Q96RP3 112 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 DPY30Q9C005 99 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 MED17Q9NVC6 651 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF175Q9Y473 711 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 KCNE3Q9Y6H6 103 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 DSCAMO60469 2012 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 A0A0J9YW62 118 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 C9JVG2 144 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 OIP5O43482 229 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 SMPD2O60906 423 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ATE1O95260 518 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 MYZAPP0CAP1 466 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 CCNA2P20248 432 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 IL11P20809 199 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 BGNP21810 368 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 MATN1P21941 496 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 SLC7A1P30825 629 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ARRB2P32121 409 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 RYKP34925 604 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 TSC22D1Q15714 1073 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 HHATQ5VTY9 493 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 EMBQ6PCB8 327 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 CBLN3Q6UW01 205 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 C6orf120Q7Z4R8 191 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 GGNQ86UU5 652 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 STK32CQ86UX6 486 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 MISPQ8IVT2 679 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF781Q8N8C0 355 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 MGARPQ8TDB4 240 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 RNF138Q8WVD3 245 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 XAGE5Q8WWM1 108 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 RAB8BQ92930 207 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 PERPQ96FX8 193 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 SLC35G5Q96KT7 338 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 FCRL1Q96LA6 429 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 KLHL15Q96M94 604 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 OR7D2Q96RA2 312 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 STACQ99469 402 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 KLHDC3Q9BQ90 382 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 PARD6BQ9BYG5 372 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 HOXD1Q9GZZ0 328 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 PIGUQ9H490 435 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 RNF122Q9H9V4 155 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 HHATLQ9HCP6 504 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 FANCFQ9NPI8 374 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 TIGARQ9NQ88 270 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 MKS1Q9NXB0 559 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PNR3 127 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 FAM221AA4D161 298 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 GJE1A6NN92 205 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ESPNB1AK53 854 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF195O14628 629 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGEF9O43307 516 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 TBX19O60806 448 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 SERPINE1P05121 402 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 TFPIP10646 304 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 KITP10721 976 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 UBL4AP11441 157 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF17P17021 662 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 SHC1P29353 583 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 SERPINB5P36952 375 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-209ENST00000480420 SLC1A6P48664 564 aa7.23□□□□□ -1.25
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