RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 NCDNQ9UBB6 729 aa15.09■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 NTNG1Q9Y2I2 539 aa15.09■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 GMPPBQ9Y5P6 360 aa15.09■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa15.09■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 KIF26BQ2KJY2 2108 aa15.09■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 THY1P04216 161 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 CCNA2P20248 432 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 LCN1P31025 176 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 ETV5P41161 510 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 RANBP1P43487 201 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 KLHL26Q53HC5 615 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 PGBD2Q6P3X8 592 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 GDF7Q7Z4P5 450 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 ZNF441Q8N8Z8 693 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 APCDD1LQ8NCL9 501 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 SETD9Q8NE22 299 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 RNF217Q8TC41 542 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 HSPBAP1Q96EW2 488 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 HRASLS5Q96KN8 279 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 PITX2Q99697 317 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 MESP1Q9BRJ9 268 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 UBQLN4Q9NRR5 601 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa15.08■□□□□ 0.01
USP20-204ENST00000472108 A0A087WUU8 490 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 C9J4A7 227 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 INHBBP09529 407 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 TGM1P22735 817 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 HTR2AP28223 471 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 PSPHP78330 225 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 OR1Q1Q15612 314 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 KLHL17Q6TDP4 642 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 FAM198BQ6UWH4 519 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 ZER1Q7Z7L7 766 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 PIP4P1Q86T03 277 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 SLCO6A1Q86UG4 719 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 GALNT6Q8NCL4 622 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 FBLIM1Q8WUP2 373 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 TAAR9Q96RI9 348 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 LPAR4Q99677 370 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 APOL4Q9BPW4 351 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 ZNF559Q9BR84 538 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 UCK2Q9BZX2 261 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 NRSN2Q9GZP1 204 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa15.08■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 TRAPPC13A5PLN9 417 aa15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 SERINC4A6NH21 518 aa15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 MT-CO3P00414 261 aa15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 CCDC159P0C7I6 412 aa15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 CRHBPP24387 322 aa15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 ADH7P40394 386 aa15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 UGT2B15P54855 530 aa15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 RNF4P78317 190 aa15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 CD47Q08722 323 aa15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 COX10Q12887 443 aa15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 CD300LDQ6UXZ3 194 aa15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 ZNF554Q86TJ5 538 aa15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 ZNF527Q8NB42 609 aa15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 ZNF566Q969W8 418 aa15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 TP53INP1Q96A56 240 aa15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 CDC14CA4D256 554 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 CSO75390 466 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 ATE1O95260 518 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 IFNGR2P38484 337 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 CLDN6P56747 220 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 NCF4Q15080 339 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 MEP1AQ16819 746 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 GPR107Q5VW38 600 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 HSDL2Q6YN16 418 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 ZNF550Q7Z398 422 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 NKAIN4Q8IVV8 208 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 VMP1Q96GC9 406 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 ADOQ96SZ5 270 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 DDA1Q9BW61 102 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 REV1Q9UBZ9 1251 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 SLC7A7Q9UM01 511 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 TSPAN2O60636 221 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 REM1O75628 298 aa15.06■□□□□ 0
USP20-204ENST00000472108 STK17BO94768 372 aa15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms