RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PANX1	Q96RD7	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	DOHH	Q9BU89	302 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	MND1	Q9BWT6	205 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	HHATL	Q9HCP6	504 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ALG5	Q9Y673	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983		A0A0B4J293	547 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	FABP12	A6NFH5	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	IQCF5	A8MTL0	148 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	LEUTX	A8MZ59	168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983		F5H5T6	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	NPC1	O15118	1278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	KPNA5	O15131	536 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	KDELR3	O43731	214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ORC5	O43913	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	STK16	O75716	305 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	LRAT	O95237	230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ANXA5	P08758	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TSPAN19	P0C672	248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ACADM	P11310	421 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PSKH1	P11801	424 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	COX7A2	P14406	83 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	AMD1	P17707	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TYMP	P19971	482 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PRPS1L1	P21108	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	MT3	P25713	68 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SDC2	P34741	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	CRYBB2	P43320	205 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PGF	P49763	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	CDH12	P55289	794 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	CLDN20	P56880	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PPP3R1	P63098	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SELENOW	P63302	87 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SMARCB1	Q12824	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	NCF4	Q15080	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	UPP1	Q16831	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SAXO2	Q658L1	398 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	NATD1	Q8N6N6	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	AP3S1	Q92572	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PSKH2	Q96QS6	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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