RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 COL8A2P25067 703 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 SERPINB1P30740 379 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 MANFP55145 182 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 ELFN2Q5R3F8 820 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 GALNT18Q6P9A2 607 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 SASS6Q6UVJ0 657 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 IKBIPQ70UQ0 350 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 FRA10AC1Q70Z53 315 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 SPATA21Q7Z572 469 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 PRUNE1Q86TP1 453 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 TRABD2AQ86V40 505 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC89Q8N998 374 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 RDH5Q92781 318 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 PAK5Q9P286 719 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 LCE6AA0A183 80 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 WNT11O96014 354 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 ATP1B1P05026 303 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 NPR2P20594 1047 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 RFX3P48380 749 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 ATP4BP51164 291 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 ARFIP1P53367 373 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 PRPS1P60891 318 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 BASP1P80723 227 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 SARNPP82979 210 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 RELBQ01201 579 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 IRF8Q02556 426 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 STX1AQ16623 288 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 OXLD1Q5BKU9 147 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 DEFB121Q5J5C9 76 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 MED27Q6P2C8 311 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 KLHL24Q6TFL4 600 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 C17orf78Q8N4C9 275 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 CKAP2Q8WWK9 683 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 SLC9A6Q92581 669 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 NPAS1Q99742 590 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 SLC17A5Q9NRA2 495 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 OXSMQ9NWU1 459 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 C7orf72A4D263 438 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 GJE1A6NN92 205 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF724A8MTY0 619 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 KLF11O14901 512 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 PIP5K1BO14986 540 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 FAM157BP0CG42 384 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 VPS41P49754 854 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 SLC25A3Q00325 362 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 CHIT1Q13231 466 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 PDK4Q16654 411 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 ARMC3Q5W041 872 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 OR4N2Q8NGD1 307 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 APH1AQ96BI3 265 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC42Q96M95 316 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 ANKRD27Q96NW4 1050 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF416Q9BWM5 594 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 FLRT3Q9NZU0 649 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 OARD1Q9Y530 152 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 TTC4O95801 387 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 ANGPTL1O95841 491 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 GYPCP04921 128 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 PCSK2P16519 638 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 SHC1P29353 583 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 MAGEA1P43355 309 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 TBCCQ15814 346 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 REP15Q6BDI9 236 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 NPSR1Q6W5P4 371 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 LAS2Q8IYD9 372 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 RNF175Q8N4F7 328 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 OR7G3Q8NG95 312 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf3-211ENST00000463372 OR4F15Q8NGB8 312 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms