RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423296.6

WDR48-204, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

TSL 4

Gene WDR48, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-204ENST00000423296 CBFA2T3O75081 653 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 INMTO95050 263 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 SOX14O95416 240 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 RECKO95980 971 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 WNT1P04628 370 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 IFNA16P05015 189 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 HTR1AP08908 422 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 ACP2P11117 423 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 TNNI3P19429 210 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 PCMT1P22061 227 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 EPHA2P29317 976 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 GABRA3P34903 492 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 STAT5AP42229 794 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 MAP2K4P45985 399 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 HSD17B7P56937 341 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 PPP1CAP62136 330 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 BNC1Q01954 994 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 MAP4K2Q12851 820 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 NFATC3Q12968 1075 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 POU4F3Q15319 338 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 SEC23BQ15437 767 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 DUSP5Q16690 384 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 DECR1Q16698 335 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 DGUOKQ16854 277 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 FHL5Q5TD97 284 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 GLRX5Q86SX6 157 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 ADCK1Q86TW2 530 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 VRK2Q86Y07 508 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 LACC1Q8IV20 430 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 GPR135Q8IZ08 494 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 OR5T3Q8NGG3 340 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 APH1BQ8WW43 257 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 FAM168AQ92567 244 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 OSTF1Q92882 214 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 PEX11GQ96HA9 241 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 SDF2Q99470 211 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 MAP3K3Q99759 626 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 ZNF559Q9BR84 538 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 RAB33BQ9H082 229 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 Q9N2J8 555 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 FAM60AQ9NP50 221 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 PRODH2Q9UF12 536 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 MKLN1Q9UL63 735 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.09□□□□□ -1.43
WDR48-204ENST00000423296 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms