RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 ILKQ13418 452 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 RAPSNQ13702 412 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 APOFQ13790 326 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SEC23BQ15437 767 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NNATQ16517 81 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 MEP1AQ16819 746 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF550Q7Z398 422 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ZAR1Q86SH2 424 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NAXDQ8IW45 347 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF721Q8TF20 911 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 DIO2Q92813 273 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SLC35B4Q969S0 331 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CFAP54Q96N23 3096 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 LRFN5Q96NI6 719 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CMKLR1Q99788 373 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 FUZQ9BT04 418 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CRB3Q9BUF7 120 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 EDEM2Q9BV94 578 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NUDT9Q9BW91 350 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM2Q9C040 744 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SLC26A1Q9H2B4 701 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 WDR54Q9H977 334 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 APMAPQ9HDC9 416 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SELENONQ9NZV5 590 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 A0A087WUU8 490 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CLDN24A6NM45 220 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 H3BN98 237 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SCDO00767 359 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TO15178 435 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 MPZL2O60487 215 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 REM1O75628 298 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 RFPL3O75679 317 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ANGPTL1O95841 491 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CSTAP01040 98 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CD63P08962 238 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC159P0C7I6 412 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CCL4P13236 92 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PRG2P13727 222 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CRHBPP24387 322 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ELK4P28324 431 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 IL12BP29460 328 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SLC5A2P31639 672 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 STAT5AP42229 794 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF136P52737 540 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NRG3P56975 720 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 GABARAPL2P60520 117 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CXCR4P61073 352 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 COPZ1P61923 177 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CDK5R2Q13319 367 aa6.11□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 FGFBP1Q14512 234 aa6.11□□□□□ -1.43
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