RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 C17orf62Q9BQA9 187 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 EVA1AQ9H8M9 152 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 ING3Q9NXR8 418 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTTG3PQ9NZH4 202 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 CALML5Q9NZT1 146 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 SEMA5BQ9P283 1151 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A0X1KG70 313 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR6C70A6NIJ9 312 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 H0YGG7 62 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 H0YIG0 161 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLDN4O14493 209 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF682O95780 498 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTHP01270 115 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 HLA-DQB1P01920 261 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 NR2F6P10588 404 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 SFTPCP11686 197 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 GABRB1P18505 474 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 CHMP24386 653 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTPN6P29350 595 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLN3Q13286 438 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 CEBPEQ15744 281 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF79Q15937 498 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 VMACQ2NL98 169 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 FCRL6Q6DN72 434 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC48A1Q6P1K1 146 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 PCSK4Q6UW60 755 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 DEDD2Q8WXF8 326 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAP6Q96JE9 813 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 MGLLQ99685 303 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 AASSQ9UDR5 926 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANGPT4Q9Y264 503 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 PADI2Q9Y2J8 665 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 CMAHPQ9Y471 501 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 LOXL2Q9Y4K0 774 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 ASB4Q9Y574 426 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A1W2PQM1 296 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNTNA6NMZ2 147 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 A8MV72 311 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 SAP18O00422 153 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 ADAMDEC1O15204 470 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 PPM1DO15297 605 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR2B3O76000 313 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 ITGB2P05107 769 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 HBQ1P09105 142 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 LIPCP11150 499 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 KDELR2P33947 212 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPC1P35052 558 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 PCGF2P35227 344 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 BTN3A2P78410 334 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 HSD11B2P80365 405 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 VLDLRP98155 873 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 TNFRSF17Q02223 184 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 ST3GAL4Q11206 333 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 BAMBIQ13145 260 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 RGNQ15493 299 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPDYE7PQ495Y7 208 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 RNLSQ5VYX0 342 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR4K14Q8NGD5 310 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 ENKURQ8TC29 256 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 NEURL3Q96EH8 262 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 HYLS1Q96M11 299 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF285Q96NJ3 590 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 CITED4Q96RK1 184 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC35A5Q9BS91 424 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC3G-201ENST00000407997 LEUTXA8MZ59 168 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 hCG_2039718K7EN88 272 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CYP7B1O75881 506 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 NSA2O95478 260 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 IL1AP01583 271 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SCG5P05408 212 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 FHP07954 510 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 STSP08842 583 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 EPHA2P29317 976 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAZP56270 477 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms