RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 ROS1P08922 2347 aa11.08□□□□□ -0.64
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PRAME-204ENST00000403441 PAX1P15863 534 aa11.07□□□□□ -0.64
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PRAME-204ENST00000403441 BEND4Q6ZU67 534 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 HDXQ7Z353 690 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 GGNQ86UU5 652 aa11.05□□□□□ -0.64
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PRAME-204ENST00000403441 OR7A2PQ8NGA2 310 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 OR8J2Q8NGG1 315 aa11.05□□□□□ -0.64
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PRAME-204ENST00000403441 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 SH3BP4Q9P0V3 963 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 VDAC3Q9Y277 283 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 PCNX3Q9H6A9 2034 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 USF3Q68DE3 2245 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 SONP18583 2426 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
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