RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378402.9

PKHD1L1-201, Transcript of PKHD1 like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKHD1L1, Length 13,076 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1-201ENST00000378402 SERINC3Q13530 473 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 TUSC1Q2TAM9 212 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 TEX44Q53QW1 395 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF783Q6ZMS7 281 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC24A5Q71RS6 500 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 BHLHE23Q8NDY6 225 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR51G2Q8NGK0 314 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 OIT3Q8WWZ8 545 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 FBXL8Q96CD0 374 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 COQ8BQ96D53 544 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 POM121Q96HA1 1249 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 TSSK3Q96PN8 268 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 TFR2Q9UP52 801 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A087WZ62 844 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A0G2JLW4 131 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 H7C417 338 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 K7EPK0 472 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CYC1P08574 325 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 MPSTP25325 297 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 RAB28P51157 221 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 EIF6P56537 245 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 NRSN1Q8IZ57 195 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR2A12Q8NGT7 310 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 DYRK2Q92630 601 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CGRRF1Q99675 332 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 WDR18Q9BV38 432 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 TSPAN16Q9UKR8 245 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 NUP188Q5SRE5 1749 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 A6NDN8 102 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 RFXANKO14593 260 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 HGFP14210 728 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 FABP4P15090 132 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ADORA2AP29274 412 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 GRM5P41594 1212 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ACTR1AP61163 376 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 RAB33AQ14088 237 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 WDR73Q6P4I2 378 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC22A18Q96BI1 424 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CXorf58Q96LI9 332 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 DBNDD2Q9BQY9 259 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRAMEF25A6NGN4 478 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRAMEF4O60810 478 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZBTB7AO95365 584 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRH1P02810 166 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CD1AP06126 327 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 S100A7P31151 101 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ACTR1BP42025 376 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CCR9P51686 369 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 TSPAN31Q12999 210 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CHIT1Q13231 466 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 TEAD2Q15562 447 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CDO1Q16878 200 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 SUSD4Q5VX71 490 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CYHR1Q6ZMK1 362 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 FA2HQ7L5A8 372 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF546Q86UE3 836 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 IMMP2LQ96T52 175 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 PITX2Q99697 317 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 HAO2Q9NYQ3 351 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCND3Q9UK17 655 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 E7EQ34 232 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 MKRN2OSH3BPM6 223 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 M0R3H8 397 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CPB1P15086 417 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CCR1P32246 355 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 GPR157Q5UAW9 335 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 NIPAL3Q6P499 406 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 UNC93AQ86WB7 457 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 SERPINA12Q8IW75 414 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 XAGE5Q8WWM1 108 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 LRIG1Q96JA1 1093 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 NPAS1Q99742 590 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 FZD3Q9NPG1 666 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ELOVL2Q9NXB9 296 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 TTC3P53804 2025 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR2A25A4D2G3 310 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 B4DXG7 233 aa3.24□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 NFKBIEO00221 500 aa3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms