RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PPICP45877 212 aa4.08□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM251Q8N6I4 163 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SYT14Q8NB59 555 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 NFKBIDQ8NI38 313 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 FNDC9Q8TBE3 224 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 L3HYPDHQ96EM0 354 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 C16orf58Q96GQ5 468 aa4.08□□□□□ -1.76
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