RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV3-25P01717 112 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM225BP0DP42 221 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CSNK1A1P48729 337 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TPMTP51580 245 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXC5Q00444 222 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 MFSD8Q8NHS3 518 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 HIF3AQ9Y2N7 669 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 A6NL46 340 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNK5O95279 499 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 LHCGRP22888 699 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 GDF1P27539 372 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 MLC1Q15049 377 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 VRK2Q86Y07 508 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SDR9C7Q8NEX9 313 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR13H1Q8NG92 308 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 INTS14Q96SY0 518 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 MMP17Q9ULZ9 603 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCG2Q9UNQ0 655 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ICKQ9UPZ9 632 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PODNL1Q6PEZ8 512 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC6A7Q99884 636 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 AIFM2Q9BRQ8 373 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNS2Q9ULS6 477 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 DCDP81605 110 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ERV3-1Q14264 604 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR1Q1Q15612 314 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 Q6ZSR9 355 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 VRK3Q8IV63 474 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SYT14Q8NB59 555 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF597Q96LX8 424 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 LYSMD1Q96S90 227 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF160Q9HCG1 818 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF850A8MQ14 1090 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV3-27P01718 113 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ERVK-25P63136 954 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM61Q5EBN2 209 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF417Q8TAU3 575 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 MRI1Q9BV20 369 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 C20orf27Q9GZN8 174 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 COPZ2Q9P299 210 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 NCS1P62166 190 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM205Q6UW68 189 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF740Q8NDX6 193 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CHRDQ9H2X0 955 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 H7C417 338 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF264O43296 627 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SIGLEC6O43699 453 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 FURINP09958 794 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 AKR1D1P51857 326 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 NFATC3Q12968 1075 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 MANEAQ5SRI9 462 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 FCRLBQ6BAA4 426 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 POGLUT1Q8NBL1 392 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TFAP2CQ92754 450 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC6A18Q96N87 628 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD12Q6UB98 2062 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGAMP11215 1152 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CXCR4P61073 352 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CHRNEQ04844 493 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC01599Q8WXQ3 324 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC32Q9BV29 185 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 C14orf119Q9NWQ9 140 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PARPBPQ9NWS1 579 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNIP1Q9NZI2 227 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 EMC3Q9P0I2 261 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 MMACHCQ9Y4U1 282 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 LCKP06239 509 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TP53I3Q53FA7 332 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 METRNLQ641Q3 311 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 AWAT2Q6E213 333 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 BEND4Q6ZU67 534 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 LHPPQ9H008 270 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PLEK2Q9NYT0 353 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 HSPB11Q9Y547 144 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 AP1G1O43747 822 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 EPHA4P54764 986 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ADPRHP54922 357 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PGGHGQ32M88 737 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 GAREM1Q9H706 876 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms