RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 RSC1A1Q92681 617 aa21.01■□□□□ 0.95
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PTPRM-201ENST00000332175 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP20.99■□□□□ 0.951e-8■■■■■ 37.2
PTPRM-201ENST00000332175 OR1Q1Q15612 314 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
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PTPRM-201ENST00000332175 MBTPS1Q14703 1052 aa20.98■□□□□ 0.95
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