RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 DUSP19Q8WTR2 217 aa25.1■■□□□ 1.61
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF559Q9BR84 538 aa25.1■■□□□ 1.61
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CTDNEP1-201ENST00000318988 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1C1Q15619 314 aa25.06■■□□□ 1.6
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MDGA2Q7Z553 956 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSD4Q8NDX1 1056 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 RHCGQ9UBD6 479 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 A4GNTQ9UNA3 340 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXPH5Q8NEV8 1989 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD33BA6NCL7 494 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa25.05■■□□□ 1.6
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