RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 SLC6A15Q9H2J7 730 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 AP3M1Q9Y2T2 418 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 NME4O00746 187 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 NUDT14O95848 222 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 NID1P14543 1247 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ETS2P15036 469 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 CALB2P22676 271 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 MSX1P28360 303 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 SRD5A2P31213 254 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ADH7P40394 386 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 CCR4P51679 360 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 SLC25A3Q00325 362 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 EIPR1Q53HC9 387 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 OR2T12Q8NG77 320 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF607Q96SK3 696 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ACKR4Q9NPB9 350 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 SPAG4Q9NPE6 437 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 TAS2R10Q9NYW0 307 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF232Q9UNY5 417 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1B0GTH9 108 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 FAM220BPB1ANY3 271 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 B2RBV5 119 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ZNHIT1O43257 154 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 IGHG3P01860 377 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 PCGF2P35227 344 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 PGM1P36871 562 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 P2RX1P51575 399 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 FOXK1P85037 733 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 LIPEQ05469 1076 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 GANABQ14697 944 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 LIN52Q52LA3 116 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF311Q5JNZ3 666 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ERICH5Q6P6B1 374 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 TRILQ7L0X0 811 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ATCAYQ86WG3 371 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 SPPL2CQ8IUH8 684 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 SLC30A8Q8IWU4 369 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 NDE1Q9NXR1 346 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ADA2Q9NZK5 511 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 VDAC3Q9Y277 283 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 IFT52Q9Y366 437 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ANKUB1A6NFN9 424 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 UBOX5O94941 541 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 THBS1P07996 1170 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 T-ENOLP0DO92 83 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 HK1P19367 917 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 SKP2Q13309 424 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ARSKQ6UWY0 536 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 C16orf89Q6UX73 402 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF836Q6ZNA1 936 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 CMIPQ8IY22 773 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 GALNT11Q8NCW6 608 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ARSGQ96EG1 525 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 KLHDC3Q9BQ90 382 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 OR2B2Q9GZK3 357 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 LAT2Q9GZY6 243 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ALG2Q9H553 416 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 PLSCR2Q9NRY7 297 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ABCD2Q9UBJ2 740 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ICAM5Q9UMF0 924 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 SLC6A5Q9Y345 797 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 HCN1O60741 890 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 SERPINB7O75635 380 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 NEIL3Q8TAT5 605 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 RLIMQ9NVW2 624 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ELOVL7A1L3X0 281 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 SUSD5O60279 629 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ZIC3O60481 467 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 GSK3BP49841 420 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 RBPJQ06330 500 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 RAET1LQ5VY80 246 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms