RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299441.4

DCHS1-201, Transcript of dachsous cadherin-related 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DCHS1, Length 10,765 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1-201ENST00000299441 TRAV18A0A075B6X5 111 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 ATP6V1G1O75348 118 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 SPHARQ15513 63 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 CCL26Q9Y258 94 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 DVL2O14641 736 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 FAM163BP0C2L3 166 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 SCGB2A2Q13296 93 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 OR8B8Q15620 311 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 IL20RBQ6UXL0 311 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 OR9A4Q8NGU2 314 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 PHOX2BQ99453 314 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 AIG1Q9NVV5 245 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 PLEK2Q9NYT0 353 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 ZNF674Q2M3X9 581 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 SMIM14Q96QK8 99 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 FAM86C1Q9NVL1 165 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 LRIT1Q9P2V4 623 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 STYXL1Q9Y6J8 313 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 SPOCK1Q08629 439 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 RAB27BO00194 218 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 KLF11O14901 512 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 AGPAT2O15120 278 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 DCNP07585 359 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 APEHP13798 732 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 SSTP61278 116 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 NCS1P62166 190 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 SSX2Q16385 188 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 EMC10Q5UCC4 262 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 OR52W1Q6IF63 320 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 PIGCQ92535 297 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 OLAHQ9NV23 265 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 SIT1Q9Y3P8 196 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 GTF3C1Q12789 2109 aa13.14□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 RBPJQ06330 500 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 FAM57BQ71RH2 274 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 POTEKPQ9BYX7 375 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 EN2P19622 333 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 IFNA1P01562 189 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 GLO1Q04760 184 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 RAB33AQ14088 237 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 SERTAD2Q14140 314 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 MORN1Q5T089 497 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 SERTAD4Q9NUC0 356 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 LTBP3Q9NS15 1303 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 OR6C6A6NF89 314 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 RAB3AP20336 220 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 MAP2K3P46734 347 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 ACY1Q03154 408 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 CMTM1Q8IZ96 169 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 OR4K15Q8NH41 348 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 DCUN1D4Q92564 292 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 FAM210AQ96ND0 272 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 A0A0G2JMP0 313 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 H0YAE9 185 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 CCL11P51671 97 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 ZNF789Q5FWF6 425 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 C6orf141Q5SZD1 244 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 OR4M2Q8NGB6 313 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 DUSP23Q9BVJ7 150 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 CHMP24386 653 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 DCAF12Q5T6F0 453 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 TXNDC15Q96J42 360 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 DECR2Q9NUI1 292 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 SPDEFO95238 335 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 CD68P34810 354 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 CASD1Q96PB1 797 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 PELI2Q9HAT8 420 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 NUMBLQ9Y6R0 609 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 OR8U9P0C7N5 309 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 CD38P28907 300 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 CLDN8P56748 225 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 SFRP5Q5T4F7 317 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 GPR149Q86SP6 731 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 ITFG2Q969R8 447 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 TBC1D20Q96BZ9 403 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 C12orf49Q9H741 205 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 FAIMQ9NVQ4 179 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 SULT1B1O43704 296 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 NXPH3O95157 252 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 DCST2Q5T1A1 773 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 RHBDF1Q96CC6 855 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 MED20Q9H944 212 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 EMC3Q9P0I2 261 aa13.13□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 CD46P15529 392 aa13.12□□□□□ -0.31
DCHS1-201ENST00000299441 MSR1P21757 451 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms