RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298537.11

SDCCAG3-201, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDCCAG3, Length 2,314 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-201ENST00000298537 SLC30A6Q6NXT4 461 aa23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZBTB44Q8NCP5 570 aa23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 CEP76Q8TAP6 659 aa23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 ADIPOR1Q96A54 375 aa23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 A0A1B0GWA3 101 aa23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 OIP5O43482 229 aa23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 CDK1P06493 297 aa23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 PSMB9P28065 219 aa23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 CD226Q15762 336 aa23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 SLITRK4Q8IW52 837 aa23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 RORBQ92753 470 aa23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 DOK1Q99704 481 aa23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 G6PC3Q9BUM1 346 aa23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 ENKD1Q9H0I2 346 aa23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 RARRES3Q9UL19 164 aa23.62■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 YKT6O15498 198 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 ACVR2AP27037 513 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 OR4Q3Q8NH05 313 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 TMEM239Q8WW34 195 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 RTN4RQ9BZR6 473 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 NGFRP08138 427 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZGLP1P0C6A0 271 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 TTKP33981 857 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 CADM2Q8N3J6 435 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 PMM1Q92871 262 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 SLC46A1Q96NT5 459 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 CLN6Q9NWW5 311 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 SRPK3Q9UPE1 567 aa23.61■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 A0A0B4J2E0 115 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 A0A1B0GX12 115 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 GSTM3P21266 225 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 FPR3P25089 353 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 RORAP35398 523 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 FXYD6P3P58550 94 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 EBPQ15125 230 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 PMEPA1Q969W9 287 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNF524Q96C55 264 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 SLC25A19Q9HC21 320 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 SERINC4A6NH21 518 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 CSTAP01040 98 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 HOXD12P35452 270 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 IFNGR2P38484 337 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 PPICP45877 212 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 PCYT1AP49585 367 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 CSNK2BP67870 215 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 ANGPT1Q15389 498 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 FGF11Q92914 225 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 ADOQ96SZ5 270 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 TSSK6Q9BXA6 273 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 ARMC7Q9H6L4 198 aa23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 IFI30P13284 250 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 BIKQ13323 160 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 AQP6Q13520 282 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 KIRREL2Q6UWL6 708 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 RABEPKQ7Z6M1 372 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 STX19Q8N4C7 294 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 TEX47Q8TBZ9 253 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 FMO6PO60774 539 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 SOX30O94993 753 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 PTHP01270 115 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 MPLP40238 635 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 EFNB1P98172 346 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 TUBA3CQ13748 450 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 SNAPC1Q16533 368 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 CBLN3Q6UW01 205 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNF620Q6ZNG0 422 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 GALNT15Q8N3T1 639 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 OR8J1Q8NGP2 316 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 TMEM27Q9HBJ8 222 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 SLC24A3Q9HC58 644 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 D6RAR5 112 aa23.58■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 SLC2A10O95528 541 aa23.58■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNF28P17035 718 aa23.58■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 SLC15A1P46059 708 aa23.58■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 TEKQ02763 1124 aa23.58■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 KLHL26Q53HC5 615 aa23.58■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 SLC27A4Q6P1M0 643 aa23.58■■□□□ 1.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZBTB46Q86UZ6 589 aa23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms