RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10G6Q8NH81 332 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NDNFQ8TB73 568 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CT55Q8WUE5 264 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 APH1BQ8WW43 257 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM19Q96HH6 336 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CEP19Q96LK0 163 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 C12orf66Q96MD2 445 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 IL17FQ96PD4 163 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 F2RL3Q96RI0 385 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC38A3Q99624 504 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZPBPQ9BS86 351 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MND1Q9BWT6 205 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX101Q9BY14 249 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DSN1Q9H410 356 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TRPC4Q9UBN4 977 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX7Q9UNH6 387 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 LIPT1Q9Y234 373 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A075B6Q4 140 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PNR3 127 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 URADA6NGE7 173 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 METTL15A6NJ78 407 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 A6NL46 340 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 H3BN98 237 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 H7BY64 318 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SYT5O00445 386 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFRSF10CO14798 259 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDH17O14917 1159 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGEB3O15480 346 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRTM2O43300 516 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 EMC8O43402 210 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MFN2O95140 757 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 FHP07954 510 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 STSP08842 583 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TFPTP0C1Z6 253 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GABRB1P18505 474 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 EPHA2P29317 976 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MPIP34949 423 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTR1BP42025 376 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GATA4P43694 442 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RGS6P49758 472 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMD7P51665 324 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CRYBA2P53672 197 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTR1AP61163 376 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CSNK1G2P78368 415 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GPLD1P80108 840 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RELAQ04206 551 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RGS1Q08116 209 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 HSPB3Q12988 150 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SQSTM1Q13501 440 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OCLNQ16625 522 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SYT16Q17RD7 645 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MPEG1Q2M385 716 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DEF8Q6ZN54 512 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RRM2BQ7LG56 351 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MFSD4AQ8N468 514 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.53□□□□□ -1.36
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