RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234142.9

GREB1-201, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GREB1, Length 8,444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-201ENST00000234142 PTTG3PQ9NZH4 202 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 GABRR1P24046 479 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ECI1P42126 302 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ATP1B3P54709 279 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 RPS18P62269 152 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 DGKZQ13574 1117 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 GALEQ14376 348 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ZNF546Q86UE3 836 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 DMBX1Q8NFW5 382 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 OR2T27Q8NH04 317 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 CREB3L4Q8TEY5 395 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ASB17Q8WXJ9 295 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 INTS14Q96SY0 518 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 QPCTLQ9NXS2 382 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 SLC17A6Q9P2U8 582 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 RAB40ALP0C0E4 278 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 RAP2BP61225 183 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 SLC22A6Q4U2R8 563 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 B3GNT7Q8NFL0 401 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 M1APQ8TC57 530 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ECHDC3Q96DC8 303 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 SFXN2Q96NB2 322 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 MICU1Q9BPX6 476 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 TAS2R16Q9NYV7 291 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ACTR10Q9NZ32 417 aa11.2□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 GPR39O43194 453 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 JUNDP17535 347 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 IMPA1P29218 277 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 PHYHD1Q5SRE7 291 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 SLC6A19Q695T7 634 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 CNTN4Q8IWV2 1026 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 DBF4BQ8NFT6 615 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 LURAP1Q96LR2 239 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 DYNLRB1Q9NP97 96 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ACVRL1P37023 503 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 CLDN8P56748 225 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ARHGAP1Q07960 439 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 TEAD2Q15562 447 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 SYPL2Q5VXT5 272 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 RABEPKQ7Z6M1 372 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 TANKQ92844 425 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 KRBOX1C9JBD0 128 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 PIGRP01833 764 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ARG2P78540 354 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 CD300LGQ6UXG3 332 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 SLC2A8Q9NY64 477 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 IL32P24001 234 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 CSNK1A1P48729 337 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ANKRD19PQ9H560 264 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 TRIP11Q15643 1979 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 LAMTOR5O43504 91 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ENPP6Q6UWR7 440 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 MUCL1Q96DR8 90 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 HRH4Q9H3N8 390 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 NT5DC2Q9H857 520 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 COQ4Q9Y3A0 265 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 SURF4O15260 269 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 GGT5P36269 586 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 FOLR3P41439 243 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 AKR1C1Q04828 323 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 TXNDC8Q6A555 127 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 LCN10Q6JVE6 187 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 GAREM2Q75VX8 874 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 DTX3Q8N9I9 347 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 HRASLSQ9HDD0 168 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ADGRB1O14514 1584 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 CDK4P11802 303 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 ZNF44P15621 663 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 PAX6P26367 422 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 PPT1P50897 306 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 OR4A16Q8NH70 328 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 DPH7Q9BTV6 452 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 KATNB1Q9BVA0 655 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 SAP130Q9H0E3 1048 aa11.19□□□□□ -0.62
GREB1-201ENST00000234142 SLC7A7Q9UM01 511 aa11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms