RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CDH18	Q13634	790 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	PEA15	Q15121	130 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SGCB	Q16585	318 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MBLAC2	Q68D91	279 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CHST9	Q7L1S5	443 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CCDC190	Q86UF4	302 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	APCDD1	Q8J025	514 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CPXM2	Q8N436	756 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	GPR152	Q8TDT2	470 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MZB1	Q8WU39	189 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF778	Q96MU6	729 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CDT1	Q9H211	546 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	IPPK	Q9H8X2	491 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	GRM6	O15303	877 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SIVA1	O15304	175 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RAD1	O60671	282 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	FSHR	P23945	695 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PBX3	P40426	434 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	GATA4	P43694	442 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PPT1	P50897	306 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PLAUR	Q03405	335 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	NFATC4	Q14934	902 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RSU1	Q15404	277 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	UGT8	Q16880	541 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	HAS1	Q92839	578 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF599	Q96NL3	588 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	FICD	Q9BVA6	458 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SGPP1	Q9BX95	441 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PHF11	Q9UIL8	331 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PALLD	Q8WX93	1383 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CASZ1	Q86V15	1759 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CRB1	P82279	1406 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	HYKK	A2RU49	373 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MGAT4D	A6NG13	374 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072		F5H6K3	240 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CYB5B	O43169	146 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SEPT4	O43236	478 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ARG1	P05089	322 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	F3	P13726	295 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	GZMH	P20718	246 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	KLRC2	P26717	231 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ACLY	P53396	1101 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PKIA	P61925	76 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ATP6V1F	Q16864	119 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CRY2	Q49AN0	593 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	C4orf17	Q53FE4	359 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	COX20	Q5RI15	118 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	DCAF15	Q66K64	600 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MAVS	Q7Z434	540 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	GPR151	Q8TDV0	419 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	FCGR1B	Q92637	280 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	DISP2	A7MBM2	1401 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM72	A0PK05	275 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	OR6C68	A6NDL8	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM170B	A6NMN3	283 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RGS14	O43566	566 aa		5.76	□□□□□ -1.49

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