RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf120Q7Z4R8 191 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB15Q8WXK1 588 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FIG4Q92562 907 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CSF3RQ99062 836 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGIXQ9H6Y5 334 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 GLOD5A6NK44 160 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 WWP2O00308 870 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 BCKDKO14874 412 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR75O95800 540 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 KLK2P20151 261 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 KDELR2P33947 212 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 XKP51811 444 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PLGLB1Q02325 96 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FOLH1Q04609 750 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 HYAL4Q2M3T9 481 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 GCNT6Q5T4J0 391 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF585AQ6P3V2 769 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC80Q76M96 950 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A16Q86VW1 577 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 OR56A1Q8NGH5 318 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 MIPOL1Q8TD10 442 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 YY1AP1Q9H869 796 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 RIMS3Q9UJD0 308 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 WASHC1A8K0Z3 465 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 AQP7O14520 342 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CNR1P21554 472 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CRATP43155 626 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK9P50750 372 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 HSPB3Q12988 150 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF595Q8IYB9 648 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC116Q8IYX3 515 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM109AQ8N4B1 249 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 NRG4Q8WWG1 115 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF145Q96MT1 663 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 C3orf14Q9HBI5 128 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC24A3Q9HC58 644 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS6KA6Q9UK32 745 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX8Q9Y5X2 465 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FIGNL2A6NMB9 653 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ACOT7O00154 380 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 EMC8O43402 210 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP1B1P05026 303 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 RAP2AP10114 183 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PORP16435 677 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 GPC1P35052 558 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SOAT1P35610 550 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PRIM2P49643 509 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC13A2Q13183 592 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SPDYE7PQ495Y7 208 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 TBCELQ5QJ74 424 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF130Q86XS8 419 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ADCY4Q8NFM4 1077 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM162AQ96A26 154 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ELP4Q96EB1 424 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM173AQ9BQD7 235 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CNPPD1Q9BV87 410 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 A4GALTQ9NPC4 353 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC42Q9Y546 428 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 NCKAP5O14513 1909 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 C1QCP02747 245 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL3P10147 92 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ARAFP10398 606 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CPMP14384 443 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FEN1P39748 380 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 DNASE1L1P49184 302 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR5P85299 388 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 COX20Q5RI15 118 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ARSKQ6UWY0 536 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 HSDL2Q6YN16 418 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 RTL4Q6ZR62 310 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SEM1Q6ZVN7 128 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 LILRA2Q8N149 483 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PKP2Q99959 881 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SH2D2AQ9NP31 389 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SPRR3Q9UBC9 169 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN4O14493 209 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 SUSD5O60279 629 aa22.01■■□□□ 1.11
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