RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625672.2

NRXN1-222, Transcript of neurexin 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NRXN1, Length 8,113 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN1-222	ENST00000625672	OR2T27	Q8NH04	317 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NRXN1-222	ENST00000625672	SIX2	Q9NPC8	291 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NRXN1-222	ENST00000625672	FBXO45	P0C2W1	286 aa		13.08	□□□□□ -0.31
NRXN1-222	ENST00000625672	NR4A2	P43354	598 aa		13.08	□□□□□ -0.31
NRXN1-222	ENST00000625672	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.31
NRXN1-222	ENST00000625672	PEBP4	Q96S96	227 aa		13.08	□□□□□ -0.31
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		13.08	□□□□□ -0.31
NRXN1-222	ENST00000625672	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.31
NRXN1-222	ENST00000625672	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		13.08	□□□□□ -0.31
NRXN1-222	ENST00000625672	JRK	O75564	520 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	LIPI	Q6XZB0	460 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	CHST14	Q8NCH0	376 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	HAS2	Q92819	552 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	MAL2	Q969L2	176 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	KIAA0513	O60268	411 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	NDUFB2	O95178	105 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	NPIPA8	P0DM63	369 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672		A0A1W2PPH5	198 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	PRKY	O43930	277 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	TANK	Q92844	425 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	MMP27	Q9H306	513 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	MKS1	Q9NXB0	559 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	MEGF11	A6BM72	1044 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	B4GAT1	O43505	415 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	STS	P08842	583 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	IDUA	P35475	653 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	RNF4	P78317	190 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	CST9LP1	Q5W188	147 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	TPPP3	Q9BW30	176 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	APOC3	P02656	99 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	TCN2	P20062	427 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	ATP6AP1	Q15904	470 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	OR7G2	Q8NG99	324 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	C17orf50	Q8WW18	174 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	RLN3	Q8WXF3	142 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	PELI2	Q9HAT8	420 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	ACPP	P15309	386 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	CD38	P28907	300 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	GSK3A	P49840	483 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	SNAPC3	Q92966	411 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	ABCG5	Q9H222	651 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672		A8MVM7	634 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	EDN1	P05305	212 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	PRSS3	P35030	304 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	NFATC4	Q14934	902 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	SLAMF9	Q96A28	289 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	ADO	Q96SZ5	270 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	HES7	Q9BYE0	225 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	GABARAP	H6UMI1	98 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	GABARAP	O95166	117 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	CTSA	P10619	480 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	VEGFB	P49765	207 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	INCA1	Q0VD86	236 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	MSS51	Q4VC12	460 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	GAA	P10253	952 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	ARSB	P15848	533 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	ITGB8	P26012	769 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	THBS3	P49746	956 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	FKBP10	Q96AY3	582 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NRXN1-222	ENST00000625672	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32

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