RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, human

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTIF-208	ENST00000590422	TNFSF11	O14788	317 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	KLF4	O43474	513 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	AKAP10	O43572	662 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	CXCL13	O43927	109 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	CRCP	O75575	148 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	NKX2-2	O95096	273 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	KCNH1	O95259	989 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	IFI6	P09912	130 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF17	P17021	662 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	SDC1	P18827	310 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	IL11	P20809	199 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	FPR1	P21462	350 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	TBXA2R	P21731	343 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	PRPH2	P23942	346 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	SHC1	P29353	583 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	PTH2R	P49190	550 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	OCRL	Q01968	901 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	MPP2	Q14168	576 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	CD226	Q15762	336 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	DUSP5	Q16690	384 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	SZRD1	Q7Z422	152 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	POC1B	Q8TC44	478 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	CCDC126	Q96EE4	140 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	FCRL1	Q96LA6	429 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	RNF145	Q96MT1	663 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	TSSK3	Q96PN8	268 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	GSX2	Q9BZM3	304 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	MED17	Q9NVC6	651 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	OXSM	Q9NWU1	459 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422		A0A0J9YW62	118 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	ADAMDEC1	O15204	470 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	NDUFB5	O43674	189 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	SEC22B	O75396	215 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	KCNK2	O95069	426 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	NGFR	P08138	427 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	PRPS2	P11908	318 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	GPC1	P35052	558 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	SLC18A1	P54219	525 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	PRKAG1	P54619	331 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	NAA20	P61599	178 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	PDE7A	Q13946	482 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	CFAP157	Q5JU67	520 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422		Q6ZSR9	355 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	NUP43	Q8NFH3	380 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	NUDT8	Q8WV74	236 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	PPCDC	Q96CD2	204 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	CCT7	Q99832	543 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	C1orf109	Q9NX04	203 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	NTM	Q9P121	344 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	TMEM120B	A0PK00	339 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	C7orf72	A4D263	438 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	TTC36	A6NLP5	189 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	INAFM1	C9JVW0	142 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	OIP5	O43482	229 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	UROS	P10746	265 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	NID1	P14543	1247 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	AGTR1	P30556	359 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	PRIM2	P49643	509 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CTIF-208	ENST00000590422	CTBP2	P56545	445 aa		10.81	□□□□□ -0.68

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