RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	SERINC4	A6NH21	518 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	ALG1L2	C9J202	215 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	FRS3	O43559	492 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	HCRTR2	O43614	444 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	SNX4	O95219	450 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	PGM3	O95394	542 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	NPPA	P01160	153 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	NGFR	P08138	427 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	T-ENOL	P0DO92	83 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	UBL4A	P11441	157 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	LCN1	P31025	176 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	PCGF2	P35227	344 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	MAGEA8	P43361	318 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF117	Q03924	483 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	LIPE	Q05469	1076 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	SNTA1	Q13424	505 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF141	Q15928	474 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	KLHL26	Q53HC5	615 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	EIPR1	Q53HC9	387 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	REEP3	Q6NUK4	255 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	CBLN3	Q6UW01	205 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	SIAH3	Q8IW03	269 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF527	Q8NB42	609 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	HIPK4	Q8NE63	616 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	BBS10	Q8TAM1	723 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	FAR1	Q8WVX9	515 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	NR4A3	Q92570	626 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	NTNG2	Q96CW9	530 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF583	Q96ND8	569 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	POLE3	Q9NRF9	147 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	CALML5	Q9NZT1	146 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	VDAC3	Q9Y277	283 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	GMEB1	Q9Y692	573 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	NBAS	A2RRP1	2371 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744		A0A0G2JPF8	293 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744		A0A1W2PQD3	144 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	AGAP5	A6NIR3	686 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744		H3BNH8	94 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	AP3D1	O14617	1153 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	GSTA4	O15217	222 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	SOX30	O94993	753 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	NUDT14	O95848	222 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	CSTA	P01040	98 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	GKN3P	P0CG01	181 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	NCK1	P16333	377 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	IL7R	P16871	459 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	HK1	P19367	917 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	CALB2	P22676	271 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	DPP4	P27487	766 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	GSK3B	P49841	420 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	TDGF1P3	P51864	188 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	PLAUR	Q03405	335 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	GNA13	Q14344	377 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	FGFBP1	Q14512	234 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RPL4-208	ENST00000564744	C3AR1	Q16581	482 aa		7.73	□□□□□ -1.17

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