RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561010.5

GABPB1-211, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene GABPB1, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-211ENST00000561010 UTS2O95399 124 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 LY6G6DO95868 133 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 SHBGP04278 402 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 HSD3B1P14060 373 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 CHMP24386 653 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 HSD3B2P26439 372 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 GABRA3P34903 492 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 PEX19P40855 299 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 SLC6A8P48029 635 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 PNLIPRP2P54317 469 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 HSPB3Q12988 150 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 LCP2Q13094 533 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 EFR3AQ14156 821 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 PON3Q15166 354 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 SPIN4Q56A73 249 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 FAM71E1Q6IPT2 247 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 AAGABQ6PD74 315 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 TIFABQ6ZNK6 161 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 MFSD4AQ8N468 514 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 CEP112Q8N8E3 955 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 CLHC1Q8NHS4 586 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 MZB1Q8WU39 189 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 RNF141Q8WVD5 230 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 PERPQ96FX8 193 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 PGM2Q96G03 612 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 DACH2Q96NX9 599 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 ASPNQ9BXN1 380 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 VDAC3Q9Y277 283 aa6.5□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 TRIM64BA6NI03 449 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 H7C1Q1 480 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 CASKO14936 926 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 NTN1O95631 604 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 PLAUP00749 431 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 CGAP01215 116 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 ABHD2P08910 425 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 INHBBP09529 407 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 NPIPA8P0DM63 369 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 PEPDP12955 493 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 POU2F1P14859 743 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 DDCP20711 480 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 NTSP30990 170 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 MPIP34949 423 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 UGT2B10P36537 528 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 CD79BP40259 229 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 KCNJ5P48544 419 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 PRKAG1P54619 331 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 DIO3P55073 304 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 PKNOX1P55347 436 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 SLC29A2Q14542 456 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 IMPG1Q17R60 797 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 Q5PR19 223 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 SZRD1Q7Z422 152 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 GGNQ86UU5 652 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 OR2T11Q8NH01 316 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 ELP4Q96EB1 424 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 ARSGQ96EG1 525 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 C18orf12Q96KH6 178 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 Q96MF0 132 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 MED18Q9BUE0 208 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 PIGMQ9H3S5 423 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 MYNNQ9NPC7 610 aa6.49□□□□□ -1.37
GABPB1-211ENST00000561010 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms