RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550144.1

CTDSP2-206, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 4

Gene CTDSP2, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-206ENST00000550144 FBXO45P0C2W1 286 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 FPR1P21462 350 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ADH7P40394 386 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 IST1P53990 364 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 CDH12P55289 794 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 MLF1P58340 268 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 TAS2R41P59536 307 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 Q0VFX4 171 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 CHAF1BQ13112 559 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 GK3PQ14409 553 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 GANABQ14697 944 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 OPN5Q6U736 354 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ZNF550Q7Z398 422 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ZNF605Q86T29 641 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 HIPK1Q86Z02 1210 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 EPHX4Q8IUS5 362 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ZNF440Q8IYI8 595 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ARMC10Q8N2F6 343 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 CBR4Q8N4T8 237 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 TTC9Q92623 222 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PRRC1Q96M27 445 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 MCHR1Q99705 422 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 FNDC11Q9BVV2 318 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 CDCP1Q9H5V8 836 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 COQ10BQ9H8M1 238 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 VNN3Q9NY84 501 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 RHCGQ9UBD6 479 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 U3KQV3 271 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ALG1L2C9J202 215 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PDLIM1O00151 329 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 SOCS2O14508 198 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 FFAR1O14842 300 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 NDUFB5O43674 189 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 FADS1O60427 444 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 FMO6PO60774 539 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 SEMA7AO75326 666 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 CYP7B1O75881 506 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 RASAL1O95294 804 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 H1F0P07305 194 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 GKN3PP0CG01 181 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 UBL4AP11441 157 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 EVI2BP34910 448 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 SSR4P51571 173 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ZNF136P52737 540 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 FBXW4P57775 412 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 HOXC5Q00444 222 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 CLN3Q13286 438 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 COLEC12Q5KU26 742 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 DCAF10Q5QP82 559 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 FNDC7Q5VTL7 733 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 FCRLBQ6BAA4 426 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 DESI1Q6ICB0 168 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PPP4R4Q6NUP7 873 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 H3F3CQ6NXT2 135 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 LYPD8Q6UX82 237 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 IZUMO2Q6UXV1 221 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 STK32CQ86UX6 486 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 GALNT4Q8N4A0 578 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PACRGLQ8N7B6 248 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 GATSQ8NAP1 163 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 POGLUT1Q8NBL1 392 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PIK3C3Q8NEB9 887 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 OR5M3Q8NGP4 307 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 OR52J3Q8NH60 311 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ASB15Q8WXK1 588 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 THAP4Q8WY91 577 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 HGDQ93099 445 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 NRBF2Q96F24 287 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ZNF559Q9BR84 538 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 SCNM1Q9BWG6 230 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ACER3Q9NUN7 267 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ACAD8Q9UKU7 415 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 A4GNTQ9UNA3 340 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ASPMQ8IZT6 3477 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms