RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 PLEKHA8Q96JA3 519 aa18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 MGLLQ99685 303 aa18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 PRRG3Q9BZD7 231 aa18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 ARMC7Q9H6L4 198 aa18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 ERGIC3Q9Y282 383 aa18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 R4GN57 208 aa18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 TGFBR3LH3BV60 316 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 OR2B3O76000 313 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 CBX7O95931 251 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 THY1P04216 161 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 FPR3P25089 353 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 OPRL1P41146 370 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF136P52737 540 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 EFNB1P98172 346 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 STX4Q12846 297 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 GRM7Q14831 915 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 SYT14P1Q58G82 188 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 GALNT12Q8IXK2 581 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 LRR1Q96L50 414 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 OR5M11Q96RB7 305 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 DCSTAMPQ9H295 470 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO34Q9NWN3 711 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC7A7Q9UM01 511 aa18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3-211ENST00000539589 CACNA1HO95180 2353 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 BRINP1O60477 761 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 NKX2-2O95096 273 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 RHAGQ02094 409 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ERV3-1Q14264 604 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 C11orf91Q3C1V1 193 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 FIGNL1Q6PIW4 674 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 MRGPREQ86SM8 312 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 NRMQ8IXM6 262 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF595Q8IYB9 648 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 FNDC8Q8TC99 324 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 OSTF1Q92882 214 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC38A2Q96QD8 506 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRN3Q9H3W5 708 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 DSN1Q9H410 356 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 HMG20AQ9NP66 347 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 OSGIN1Q9UJX0 560 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 OR2W5A6NFC9 320 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CLDN25C9JDP6 229 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CTNSO60931 367 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF846Q147U1 533 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 RNLSQ5VYX0 342 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 USP43Q70EL4 1123 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 KMT5CQ86Y97 462 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC34A3Q8N130 599 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM163Q8TC26 289 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM255BQ8WV15 326 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 S100ZQ8WXG8 99 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 RIT1Q92963 219 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 HSPBAP1Q96EW2 488 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 TEX12Q9BXU0 123 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CUTCQ9NTM9 273 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CLDN16Q9Y5I7 305 aa18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 GXYLT2A0PJZ3 443 aa18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAPPC13A5PLN9 417 aa18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CDHR4A6H8M9 788 aa18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 SNTNA6NMZ2 147 aa18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 PEX12O00623 359 aa18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CLDN4O14493 209 aa18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 NTN1O95631 604 aa18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CKMT1AP12532 417 aa18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKDD1AQ495B1 522 aa18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 RCBTB1Q8NDN9 531 aa18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 IFI44Q8TCB0 444 aa18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 RACGAP1Q9H0H5 632 aa18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNE5Q9UJ90 142 aa18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 MAU2Q9Y6X3 613 aa18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF749O43361 778 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 FMO6PO60774 539 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 MSL3P1P0C860 447 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 S1PR1P21453 382 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 TGFBR1P36897 503 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 PRR23CQ6ZRP0 262 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 TTLL10Q6ZVT0 673 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 OR8D4Q8NGM9 314 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 FGF11Q92914 225 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 NAT6Q93015 286 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms