RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520898.5

UBR5-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5, human

TSL 3

Gene UBR5, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBR5-208	ENST00000520898	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	STX16	O14662	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	FGF17	O60258	216 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TMCC2	O75069	709 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SCEL	O95171	688 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	IFNA2	P01563	188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CLPS	P04118	112 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CCDC175	P0C221	793 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CYP4B1	P13584	511 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	COX7A2	P14406	83 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GNAZ	P19086	355 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PTPN6	P29350	595 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	THBS4	P35443	961 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CASP3	P42574	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	MSH2	P43246	934 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	KCNJ1	P48048	391 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CPA2	P48052	419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SLC6A12	P48065	614 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PGGT1B	P53609	377 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SLC37A1	P57057	533 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	FBXW4	P57775	412 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CDKL1	Q00532	357 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ID2	Q02363	134 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	BIK	Q13323	160 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TNK1	Q13470	666 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GAB1	Q13480	694 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	RCAN2	Q14206	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	EIPR1	Q53HC9	387 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	BBOF1	Q8ND07	529 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	MCU	Q8NE86	351 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ANKRD7	Q92527	254 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	WDR34	Q96EX3	536 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	F2RL3	Q96RI0	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	EHD1	Q9H4M9	534 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CAD	P27708	2225 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898		A0A087X1B8	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898		A0A1W2PNV4	684 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	OR6C76	A6NM76	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TP53I11	O14683	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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