RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 S100A3P33764 101 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 TIMP3P35625 211 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN20P56880 219 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXF2Q12947 444 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 RCAN2Q14206 197 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 DPY19L1Q2PZI1 675 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM44Q2T9K0 475 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 SAXO2Q658L1 398 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 CBLN3Q6UW01 205 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 GCNT2Q8N0V5 402 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTRT2Q8TDY3 377 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB8BQ92930 207 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 C7orf26Q96N11 449 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC115Q96NT0 180 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 EBF4Q9BQW3 602 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35A5Q9BS91 424 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PTGES2Q9H7Z7 377 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC6A13Q9NSD5 602 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNE5Q9UJ90 142 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PQD3 144 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPB2A8KAH6 182 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 SLCO1B7G3V0H7 640 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 HCRTR2O43614 444 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 TGM6O95932 706 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PGRP06401 933 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT16P08779 473 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP6V1C1P21283 382 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 DLX5P56178 289 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPB2Q16082 182 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PLPPR5Q32ZL2 321 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 FLYWCH1Q4VC44 716 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 ANXA8L1Q5VT79 327 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 GDF7Q7Z4P5 450 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 HMGN2P46Q86SG4 172 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF614Q8N883 585 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC8CQ8TDW0 803 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF524Q96C55 264 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 SDF2Q99470 211 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 VIPAS39Q9H9C1 493 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 FCMRO60667 390 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 IL2RAP01589 272 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 GSNP06396 782 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 OR12D1P0DN82 309 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 HPGDP15428 266 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 UQCRC2P22695 453 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 LCN1P31025 176 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP10-9P60411 292 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL26Q53HC5 615 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PDZK1Q5T2W1 519 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 EPGNQ6UW88 154 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 GGNQ86UU5 652 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 POC1BQ8TC44 478 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 MIPOL1Q8TD10 442 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 NEURL3Q96EH8 262 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 DTNBP1Q96EV8 351 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52E6Q96RD3 313 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 SPOCK3Q9BQ16 436 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF350Q9GZX5 532 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 CALHM2Q9HA72 323 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 MED17Q9NVC6 651 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 BTNL2Q9UIR0 455 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHGB4Q9UN71 923 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 POLQO75417 2590 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 IDO1P14902 403 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 IL11P20809 199 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP2R2AP63151 447 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXF1Q12946 379 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR68Q15743 365 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 GTDC1Q4AE62 458 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 TIGD2Q4W5G0 525 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 BHLHB9Q6PI77 547 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF130Q86XS8 419 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 FIG4Q92562 907 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF145Q96MT1 663 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PANX1Q96RD7 426 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PIGQQ9BRB3 760 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM185BQ9H7F4 350 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 MKLN1Q9UL63 735 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 CARD8Q9Y2G2 431 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 MPDZO75970 2070 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms