RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 DESI1Q6ICB0 168 aa13.24□□□□□ -0.29
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SH3BP2-208ENST00000504294 OR5W2Q8NH69 310 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC38A5Q8WUX1 472 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR60Q8WVS4 1066 aa13.22□□□□□ -0.29
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SH3BP2-208ENST00000504294 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
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