RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CENPPQ6IPU0 288 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 SERINC5Q86VE9 423 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 MCOLN2Q8IZK6 566 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 CNPY4Q8N129 248 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC43Q8N309 656 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 CSNK1A1LQ8N752 337 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 STXBP6Q8NFX7 210 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 FAHD2AQ96GK7 314 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 SLC6A7Q99884 636 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 COX16Q9P0S2 106 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 DPM3Q9P2X0 92 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 FAM220BPB1ANY3 271 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SLC2A10O95528 541 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 H2BFMP0C1H6 154 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 UQCRC2P22695 453 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRC-212ENST00000491302 MAGEA9P43362 315 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRC-212ENST00000491302 KCNJ11Q14654 390 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRC-212ENST00000491302 NDUFA9Q16795 377 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 CEP55Q53EZ4 464 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 ATF7IP2Q5U623 682 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 FAM71F2Q6NXP2 309 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 OR10A7Q8NGE5 316 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 GLT8D2Q9H1C3 349 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 OARD1Q9Y530 152 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SAGE2PA6NJ88 616 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 BTN3A3O00478 584 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 MSH4O15457 936 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRC-212ENST00000491302 CD55P08174 381 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 PGAM2P15259 253 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 ACADSP16219 412 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 XCR1P46094 333 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 IST1P53990 364 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A6Q4U2R8 563 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SYT10Q6XYQ8 523 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 OR9A4Q8NGU2 314 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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PTPRC-212ENST00000491302 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf66Q96MD2 445 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 OR5B2Q96R09 309 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRC-212ENST00000491302 LRRC40Q9H9A6 602 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 L3MBTL1Q9Y468 752 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 ALG6Q9Y672 507 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 FRMPD4Q14CM0 1322 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 E9PLD3 99 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 EFNA2O43921 213 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 F10P00742 488 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 OPN1MWP04001 364 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 OPN1MW2P0DN77 364 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 OPN1MW3P0DN78 364 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF44P15621 663 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 HNF1AP20823 631 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-212ENST00000491302 VLDLRP98155 873 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 PAX2Q02962 417 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 RUNX3Q13761 415 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 GANABQ14697 944 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINA9Q86WD7 417 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-212ENST00000491302 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 VCX2Q9H322 139 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 PIPOXQ9P0Z9 390 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 CSAG2Q9Y5P2 127 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WWV3 80 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 OR7A17O14581 309 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 GPAA1O43292 621 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINA2P20848 420 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 HPCAL1P37235 193 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 RAB40BQ12829 278 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 RIPK1Q13546 671 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 DPYSL3Q14195 570 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-212ENST00000491302 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa5.93□□□□□ -1.46
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