RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 NUAK2Q9H093 628 aa16.07■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 RGS13O14921 159 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SSX4O60224 188 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CBX7O95931 251 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 IFNA16P05015 189 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SPANXN2Q5MJ10 180 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 VRK2Q86Y07 508 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 KRT73Q86Y46 540 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 GALNT12Q8IXK2 581 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PTCHD1Q96NR3 888 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 THSD1Q9NS62 852 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 FBXO34Q9NWN3 711 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CFAP54Q96N23 3096 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ADAMTS20P59510 1910 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 FER1L5A0AVI2 2057 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 A0A087WV62 115 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 M0R3H8 397 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 TIAF1O95411 115 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 EPPINO95925 133 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 APOA1P02647 267 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CKMT1AP12532 417 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 GABRB1P18505 474 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 S1PR1P21453 382 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SOX6P35712 828 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ETV6P41212 452 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SQSTM1Q13501 440 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 MINDY4Q4G0A6 757 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 AGAP6Q5VW22 663 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 OR4D9Q8NGE8 314 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 BBS10Q8TAM1 723 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 AGAP4Q96P64 663 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 DGAT2Q96PD7 388 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 BCL2L10Q9HD36 194 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 LANCL2Q9NS86 450 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 TAS2R16Q9NYV7 291 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ENOPH1Q9UHY7 261 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 NOX1Q9Y5S8 564 aa16.06■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 A0A0G2JPF8 293 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 DUXAA6NLW8 204 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 A8MUA0 341 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 M0R129 80 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 GDF9O60383 454 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SEMA7AO75326 666 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SNX4O95219 450 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 IFNW1P05000 195 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 GCGRP47871 477 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 IRF3Q14653 427 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PHF19Q5T6S3 580 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SLX4IPQ5VYV7 408 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 DEF8Q6ZN54 512 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 GPR151Q8TDV0 419 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF354BQ96LW1 612 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CNPPD1Q9BV87 410 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF304Q9HCX3 659 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ENPP4Q9Y6X5 453 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 KIAA0513O60268 411 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 KRT8P05787 483 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 GABRA3P34903 492 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CDC42P60953 191 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 MAP4K2Q12851 820 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 GNA13Q14344 377 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC190Q86UF4 302 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 LAPTM4BQ86VI4 370 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 TMEM151BQ8IW70 566 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SLC38A9Q8NBW4 561 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CLIP3Q96DZ5 547 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 DTX4Q9Y2E6 619 aa16.05■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 GXYLT2A0PJZ3 443 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 NPIPA7E9PJI5 369 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 FFAR1O14842 300 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 NPIPA8P0DM63 369 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 TNNI3P19429 210 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 RFX3P48380 749 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 EFNA3P52797 238 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 HSD17B7P56937 341 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 GPR68Q15743 365 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 FIGNL1Q6PIW4 674 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 FRRS1Q6ZNA5 592 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 UTS2BQ765I0 119 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms