RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 KLHL1Q9NR64 748 aa8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 KCNE3Q9Y6H6 103 aa8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 A0A087WZY1 265 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ERICH4A6NGS2 130 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 AQP12BA6NM10 295 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 LINC01387J3KSC0 135 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 MASP2O00187 686 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SYT5O00445 386 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 GPR37O15354 613 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 FADS1O60427 444 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 UGT2B17O75795 530 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 LINGO3P0C6S8 592 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 FAM87AP0C7U9 286 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CD1EP15812 388 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 EIF1P41567 113 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 HTR3AP46098 478 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 P2RX1P51575 399 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CCR4P51679 360 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SELENOWP63302 87 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 KCNC4Q03721 635 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 FGFBP1Q14512 234 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ADRM1Q16186 407 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 PLCZ1Q86YW0 608 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 AQP12AQ8IXF9 295 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 MDS2Q8NDY4 140 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 OR4C3Q8NH37 302 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 STMN2Q93045 179 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 HGDQ93099 445 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM8Q9BZR9 551 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 LAT2Q9GZY6 243 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM27Q9HBJ8 222 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CD300AQ9UGN4 299 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 DKKL1Q9UK85 242 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 DSPPQ9NZW4 1301 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 APC2O95996 2303 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SPEGQ15772 3267 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 C2orf72A6NCS6 295 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 H0YHG0 523 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 TFECO14948 347 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 NEURL1O76050 574 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 PDE5AO76074 875 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 F10P00742 488 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SERPINA1P01009 418 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 IFNW1P05000 195 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CD247P20963 164 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 GDF1P27539 372 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 GZMMP51124 257 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 MAP2K6P52564 334 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SMIM11AP58511 58 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CHRNB3Q05901 458 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CEACAM7Q14002 265 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 IFI44LQ53G44 452 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 AAGABQ6PD74 315 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 LYPD8Q6UX82 237 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZS92 163 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ASRGL1Q7L266 308 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 GALNT10Q86SR1 603 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 MARCH3Q86UD3 253 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SPATA24Q86W54 205 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 OR2M7Q8NG81 312 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 GRHL3Q8TE85 626 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SLC39A7Q92504 469 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ZBTB8AQ96BR9 441 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SCMH1Q96GD3 660 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 NODALQ96S42 347 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF559Q9BR84 538 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM2Q9C040 744 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms