RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SGCZ	Q96LD1	299 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	LMF1	Q96S06	567 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	RASL10B	Q96S79	203 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	PSD2	Q9BQI7	771 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	DPH1	Q9BZG8	443 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	LAT2	Q9GZY6	243 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC42	Q9Y546	428 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529		V9GYQ6	96 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SCN2A	Q99250	2005 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CDC14C	A4D256	554 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529		H3BNH8	94 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	WWP2	O00308	870 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	SCD	O00767	359 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	GNGT2	O14610	69 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAM10	O14672	748 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	UGT2B11	O75310	529 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2J2	O76002	312 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5F1	O95221	314 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	LIF	P15018	202 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	FPR1	P21462	350 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	IFNA8	P32881	189 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	PLAUR	Q03405	335 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	TGIF1	Q15583	401 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	NPTX1	Q15818	432 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	APOOL	Q6UXV4	268 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	LACC1	Q8IV20	430 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	LINC00471	Q8N535	108 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	EME1	Q96AY2	570 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	PRRC1	Q96M27	445 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	FRMD6	Q96NE9	622 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF559	Q9BR84	538 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	FUZ	Q9BT04	418 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM2	Q9C040	744 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	REEP1	Q9H902	201 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	RLIM	Q9NVW2	624 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ACACA	Q13085	2346 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	APC2	O95996	2303 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529		G3V2T6	193 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	AP3D1	O14617	1153 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	TP53I11	O14683	189 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ICOSLG	O75144	302 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ITGA10	O75578	1167 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	RASAL1	O95294	804 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CSTA	P01040	98 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	MT-ND1	P03886	318 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ITGAM	P11215	1152 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	HPGD	P15428	266 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	TNFRSF1B	P20333	461 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	GAS1	P54826	345 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	RRAD	P55042	308 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	DLX5	P56178	289 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ST3GAL3	Q11203	375 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CLN3	Q13286	438 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP1A4	Q13733	1029 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	NNAT	Q16517	81 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	COLEC12	Q5KU26	742 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF613	Q6PF04	617 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	AMER2	Q8N7J2	671 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	RDH12	Q96NR8	316 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	USE1	Q9NZ43	259 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54

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