RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441439.6

LMO3-208, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,515 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-208ENST00000441439 TMEM161AQ9NX61 479 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-208ENST00000441439 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-208ENST00000441439 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-208ENST00000441439 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LMO3-208ENST00000441439 CCDC88CQ9P219 2028 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-208ENST00000441439 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 H7C2Y5 167 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 VNN2O95498 520 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 EPXP11678 715 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 MGMTP16455 207 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 IMPA1P29218 277 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 SGSHP51688 502 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 SCAND1P57086 179 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 RPS24P62847 133 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 GPR142Q7Z601 462 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 PAQR7Q86WK9 346 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 KLBQ86Z14 1044 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 SKA3Q8IX90 412 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 ACBD7Q8N6N7 88 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 ABHD4Q8TB40 342 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 TCEAL4Q96EI5 215 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 CA10Q9NS85 328 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 OR6C2Q9NZP2 312 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.34□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 A0A087WUU8 490 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 FAM74A7A6NL05 159 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 ANHXE9PGG2 379 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 OGG1O15527 345 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 RDH16O75452 317 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 OR5F1O95221 314 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 ATP1B1P05026 303 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 UCHL1P09936 223 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 OR4Q2P0C623 313 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 RAB3BP20337 219 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 CFPP27918 469 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 SHC1P29353 583 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 INSL4Q14641 139 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 TRAM2Q15035 370 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 CCDC157Q569K6 752 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 NIPAL3Q6P499 406 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 CRTC1Q6UUV9 634 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 TMEM64Q6YI46 380 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 DEF8Q6ZN54 512 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 COMTD1Q86VU5 262 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 OR5W2Q8NH69 310 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 DIO2Q92813 273 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 EDAQ92838 391 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 WFDC6Q9BQY6 131 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 B4GALT2O60909 372 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 ATG12O94817 140 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 PCDH8O95206 1070 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 IL3P08700 152 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 CD3GP09693 182 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 GRK4P32298 578 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 SFXN5Q8TD22 340 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 UBE2E3Q969T4 207 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 PIGMQ9H3S5 423 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 ELP3Q9H9T3 547 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 PLCL2Q9UPR0 1127 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 LGALS8O00214 317 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 STX11O75558 287 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 STC2O76061 302 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 DDNO94850 711 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 MT-ND4P03905 459 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 MT-ND5P03915 603 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-208ENST00000441439 TM4SF4P48230 202 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms