RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 ACAD8Q9UKU7 415 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MROH1Q8NDA8 1641 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 KNG1P01042 644 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 LCKP06239 509 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TAS2R19P59542 299 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OGDHQ02218 1023 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MICAQ29983 383 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FIGLAQ6QHK4 219 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SBSNQ6UWP8 590 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 C3orf49Q96BT1 292 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 UHRF2Q96PU4 802 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 INTS14Q96SY0 518 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PHLPP1O60346 1717 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 COCHO43405 550 aa6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 DRD1P21728 446 aa6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OTOFQ9HC10 1997 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TYROBPO43914 113 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SPTBP11277 2137 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 DOC2AQ14183 400 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 GRB7Q14451 532 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SLC10A1Q14973 349 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SFXN2Q96NB2 322 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OR5B2Q96R09 309 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MICU1Q9BPX6 476 aa6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 CWH43Q9H720 699 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 NT5DC2Q9H857 520 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PQU0 124 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 GABARAPH6UMI1 98 aa6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 ARPC5O15511 151 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 LYRM1O43325 122 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 GABARAPO95166 117 aa6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 SLC11A1P49279 550 aa6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 CST6Q15828 149 aa6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 MSTNO14793 375 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MPIG6BO95866 241 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FOLR3P41439 243 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CSNK1A1P48729 337 aa6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 LMAN2Q12907 356 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 UPP1Q16831 310 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TMEM135Q86UB9 458 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ACVR1CQ8NER5 493 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OR56B4Q8NH76 319 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PSMF1Q92530 271 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MUL1Q969V5 352 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PEX11GQ96HA9 241 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 GPR174Q9BXC1 333 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CACNG2Q9Y698 323 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OR5K3A6NET4 321 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 IGLON5A6NGN9 336 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 WNT7AO00755 349 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 UPK1BO75841 260 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 NPIPA8P0DM63 369 aa6.31□□□□□ -1.4
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