RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 NEUROD4Q9HD90 331 aa12.47□□□□□ -0.41
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PRAME-209ENST00000439106 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
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PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PNV4 684 aa12.46□□□□□ -0.41
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PRAME-209ENST00000439106 C21orf58P58505 322 aa12.45□□□□□ -0.42
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PRAME-209ENST00000439106 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 MEAF6Q9HAF1 191 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 CARD8Q9Y2G2 431 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
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PRAME-209ENST00000439106 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PQD3 144 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 A6NNC1 897 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 SDHDO14521 159 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 SCN2BO60939 215 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 AQP8O94778 261 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 MATN1P21941 496 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 SHC1P29353 583 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
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PRAME-209ENST00000439106 UFM1P61960 85 aa12.44□□□□□ -0.42
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PRAME-209ENST00000439106 SMU1Q2TAY7 513 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 C6orf120Q7Z4R8 191 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 BTLAQ7Z6A9 289 aa12.44□□□□□ -0.42
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PRAME-209ENST00000439106 METTL25Q8N6Q8 603 aa12.44□□□□□ -0.42
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PRAME-209ENST00000439106 MOAP1Q96BY2 351 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 ZNF524Q96C55 264 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 STARD4Q96DR4 205 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 MARK4Q96L34 752 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 OR51I1Q9H343 314 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAME-209ENST00000439106 TMBIM4Q9HC24 238 aa12.44□□□□□ -0.42
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