RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF122	Q9H9V4	155 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A087WZY1	265 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PQD3	144 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	C7orf72	A4D263	438 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SEC14L5	O43304	696 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	HSPA4L	O95757	839 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	HRG	P04196	525 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SERPINB4	P48594	390 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	C21orf58	P58505	322 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF844	Q08AG5	666 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CPTP	Q5TA50	214 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CDC73	Q6P1J9	531 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	COX18	Q8N8Q8	333 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ZIM3	Q96PE6	472 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	NPAS1	Q99742	590 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	BTBD2	Q9BX70	525 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	PIGU	Q9H490	435 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	VDAC3	Q9Y277	283 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	HIVEP2	P31629	2446 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGEF9	O43307	516 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ITM2A	O43736	263 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	LY6G6D	O95868	133 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CGA	P01215	116 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	PRPS1L1	P21108	318 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	PON3	Q15166	354 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT71	Q3SY84	523 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	MISP	Q8IVT2	679 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	GATS	Q8NAP1	163 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	JADE3	Q92613	823 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ADGRG7	Q96K78	797 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ASIC5	Q9NY37	505 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	COL6A5	A8TX70	2615 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SH3D21	A4FU49	640 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	GMFG	O60234	142 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	C6orf47	O95873	294 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SERPINE1	P05121	402 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	G6PD	P11413	515 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CLDN8	P56748	225 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	EMX2	Q04743	252 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CD226	Q15762	336 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SMU1	Q2TAY7	513 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SFXN5	Q8TD22	340 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SMPDL3B	Q92485	455 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CDS1	Q92903	461 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	PGM2	Q96G03	612 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	MDFI	Q99750	246 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	MED17	Q9NVC6	651 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB21	Q9UL25	225 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		15.92	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PPR1	153 aa		15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SCD	O00767	359 aa		15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	BIRC5	O15392	142 aa		15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	AQP8	O94778	261 aa		15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SOX30	O94993	753 aa		15.91	■□□□□ 0.14

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