RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCN2BO60939 215 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAPPC6AO75865 159 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNX4O95219 450 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 EPPINO95925 133 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 LBPP18428 481 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 HOXC12P31275 282 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CPA2P48052 419 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 WNT3P56703 355 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 SORDQ00796 357 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNTA1Q13424 505 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q5PR19 223 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CPTPQ5TA50 214 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 NAXEQ8NCW5 288 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR8J2Q8NGG1 315 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR5P2Q8WZ92 322 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 TESCQ96BS2 214 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CMTM5Q96DZ9 223 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM41AQ96HV5 264 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF597Q96LX8 424 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRIB1Q96RU8 372 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 EBF4Q9BQW3 602 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 NMUR2Q9GZQ4 415 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 TAGLN3Q9UI15 199 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CAPN7Q9Y6W3 813 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 RTTNQ86VV8 2226 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1W2PRB8 838 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 TTC36A6NLP5 189 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 B4DXG7 233 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CASKO14936 926 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC22A2O15244 555 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 EMC8O43402 210 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMPD2O60906 423 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 NKX2-2O95096 273 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 DDX5P17844 614 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 EPHA3P29320 983 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPC1P35052 558 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 OPRM1P35372 400 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 GCKP35557 465 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 TIMP3P35625 211 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 MASP1P48740 699 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 PNLIPRP2P54317 469 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAS1P54826 345 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPP38P78345 283 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 PHC1P78364 1004 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAB1Q13480 694 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 RCAN2Q14206 197 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 MFSD12Q6NUT3 480 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 NUP43Q8NFH3 380 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACTRT2Q8TDY3 377 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 TEX37Q96LM6 180 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 COL21A1Q96P44 957 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADOQ96SZ5 270 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 DUSP26Q9BV47 211 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CXorf36Q9H7Y0 433 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACKR4Q9NPB9 350 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATAD3AQ9NVI7 634 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 AIG1Q9NVV5 245 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAPRE3Q9UPY8 281 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 E9PBE3 544 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 FADS1O60427 444 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 ICOSLGO75144 302 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 REM1O75628 298 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 LY6G6DO95868 133 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 C6orf47O95873 294 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGKV1D-16P01601 117 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACP2P11117 423 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYP4B1P13584 511 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 CTSSP25774 331 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 PTPN6P29350 595 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRDX6P30041 224 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF136P52737 540 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 NCALDP61601 193 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 HBA1P69905 142 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 MXRA7P84157 204 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 EFR3AQ14156 821 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
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